More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04050 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04050  predicted membrane protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.818037 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  51.37 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2399  protein of unknown function UPF0126  29.54 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.53799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  31.22 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  28.7 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  31.22 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0017  protein of unknown function UPF0126  30.3 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000429816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  29.73 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  28.02 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  28.02 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  28.02 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  28.02 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  31.07 
 
 		 206 aa  92.8  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  31.11 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  27.54 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  30.73 
 
 		 222 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  27.54 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  28.12 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  27.05 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  27.05 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  27.05 
 
 		 213 aa  89  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  32.12 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  30.1 
 
 		 222 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  28.71 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  31.22 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  29.95 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  27.14 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  29.27 
 
 		 208 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  32.67 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  26.04 
 
 		 205 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  26.8 
 
 		 206 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  31.03 
 
 		 208 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  29.44 
 
 		 211 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  26.4 
 
 		 211 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  33.12 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  26.74 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18070  predicted membrane protein  23.74 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0302  protein of unknown function UPF0126  30.69 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  26.04 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  31.87 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  29.27 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  29.27 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  29.27 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  29.27 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  29.27 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  30.92 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  28.78 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  28.78 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  29.84 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  29.81 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  25.82 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  31.09 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  28.4 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  32.06 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  36.03 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  28.89 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  25.57 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2740  protein of unknown function UPF0126  29.41 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  29.35 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  27.75 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  32.32 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  28.64 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  25.4 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  29.95 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  29.02 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  29.02 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  29.3 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  26.04 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  27.78 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  26.04 
 
 		 211 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  25 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  25.67 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  27.23 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  28.88 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2200  hypothetical protein  26.76 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138246  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  23.5 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  28.29 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  25.65 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  35.22 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  28.42 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  26.74 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  27.86 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  26.74 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  24.62 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1555  protein of unknown function UPF0126  30.24 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.283277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  28.24 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  26.96 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  26.96 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  26.37 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  27.23 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  31.32 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  24.37 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  27.5 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  26.26 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  27.88 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  25 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  26.7 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  28.92 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>