More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18070 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18070  predicted membrane protein  100 
 
 		 258 aa  524  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2399  protein of unknown function UPF0126  40.09 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.53799 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  31.25 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  29.63 
 
 		 201 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  30.54 
 
 		 222 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  28.33 
 
 		 203 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  29.08 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  28.65 
 
 		 205 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  29.35 
 
 		 218 aa  89  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  27.72 
 
 		 213 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  27.72 
 
 		 213 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  27.72 
 
 		 213 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  27.72 
 
 		 213 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  32.47 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  31.05 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  28.95 
 
 		 205 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  27.44 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  30.26 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  28.42 
 
 		 206 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  28.74 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  29.56 
 
 		 222 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  31.21 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  31.21 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  28.71 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  30.05 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04050  predicted membrane protein  23.74 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.818037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  31.05 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  31.25 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  26.73 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  25.59 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  28.33 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  27.23 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  26.98 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  32.08 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  27.18 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  28.89 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  27.23 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  27.23 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  30.68 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  27.45 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  27.89 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  29.06 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  36.22 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  26.96 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  27.69 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  27.89 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  31.87 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  26.96 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  27.69 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  30.16 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  26.96 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  26.96 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  26.96 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  26.96 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  29.15 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  26.96 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  30 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  27.45 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  28.64 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  29.19 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  35.14 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  30.64 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  30.06 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  31.22 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  28.26 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  27.98 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  27.78 
 
 		 202 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  27.78 
 
 		 202 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  27.78 
 
 		 202 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  27.78 
 
 		 202 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  27.78 
 
 		 202 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  27.78 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  30.3 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  32.66 
 
 		 206 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  29.38 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  27.75 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1850  hypothetical protein  28.93 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  27.78 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  25.56 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  31.18 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  29.83 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  29.55 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  29.83 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  32.28 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  29.83 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  25.62 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  29.31 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  31.95 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  31.58 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  32.95 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  32.95 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>