More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2715 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
317 aa  640    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04050  predicted membrane protein  51.37 
 
 
262 aa  294  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.818037 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2399  protein of unknown function UPF0126  38.18 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.53799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  32.38 
 
 
217 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  32.71 
 
 
245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0017  protein of unknown function UPF0126  32.19 
 
 
247 aa  106  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000429816  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18070  predicted membrane protein  31.25 
 
 
258 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  30.05 
 
 
218 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  32.18 
 
 
222 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  32.96 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  35.2 
 
 
211 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  30.69 
 
 
230 aa  96.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  35.03 
 
 
211 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  32.18 
 
 
222 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  33.67 
 
 
203 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  28.37 
 
 
217 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  30.73 
 
 
222 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  31.68 
 
 
222 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  30.46 
 
 
222 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  30.5 
 
 
218 aa  93.6  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  33.85 
 
 
211 aa  93.2  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  33.51 
 
 
206 aa  92.8  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  29.05 
 
 
210 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  27.85 
 
 
218 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  33.51 
 
 
221 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  27.27 
 
 
246 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  30.65 
 
 
210 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  30.77 
 
 
211 aa  89.4  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  31.98 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  30.93 
 
 
205 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  28.64 
 
 
213 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  28.79 
 
 
213 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  28.79 
 
 
213 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  32.67 
 
 
211 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  28.28 
 
 
213 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  30.23 
 
 
206 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  28.14 
 
 
207 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  27.55 
 
 
206 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  31.28 
 
 
205 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  27.27 
 
 
213 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  27.27 
 
 
213 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  27.27 
 
 
213 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  30.92 
 
 
207 aa  85.9  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  27.27 
 
 
213 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  27.27 
 
 
217 aa  85.9  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  28.87 
 
 
217 aa  85.5  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2740  protein of unknown function UPF0126  30.69 
 
 
225 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  31.94 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  33.8 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  34.48 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  30.85 
 
 
221 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  30.5 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  30.85 
 
 
221 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  28.92 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  31.28 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  31.31 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  27.14 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  27.45 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  27.45 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  32.5 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  26.6 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  26.47 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  31.94 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  31.41 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  28.23 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  31.96 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  31.66 
 
 
203 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0302  protein of unknown function UPF0126  32.49 
 
 
239 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  29.5 
 
 
211 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  29.53 
 
 
205 aa  82  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  28.09 
 
 
201 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  29.5 
 
 
207 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  31.09 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  31.85 
 
 
209 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  29.17 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  31.16 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  31.22 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  31.22 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  36.3 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  30.41 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  30.35 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  31.94 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15050  predicted membrane protein  35.62 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0337653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  31.18 
 
 
205 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  31.18 
 
 
205 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0065  hypothetical protein  31.18 
 
 
205 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0883885  hitchhiker  0.000264981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  29.53 
 
 
209 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  31.18 
 
 
205 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  31.18 
 
 
205 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  31.18 
 
 
205 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  31.18 
 
 
205 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4149  hypothetical protein  31.18 
 
 
205 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  31.18 
 
 
205 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  32.43 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  31.02 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>