More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15050  predicted membrane protein  100 
 
 		 292 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0337653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  44.55 
 
 		 226 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1950  protein of unknown function UPF0126  48.99 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.791374  hitchhiker  0.00643781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  35.27 
 
 		 218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  36.13 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  40.2 
 
 		 207 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  42.6 
 
 		 212 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  42.6 
 
 		 212 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  42.6 
 
 		 212 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  29.31 
 
 		 317 aa  99  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  39.62 
 
 		 203 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  38.36 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  39.46 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  34.83 
 
 		 211 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  37.91 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  35.29 
 
 		 218 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  33.99 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  39.58 
 
 		 211 aa  86.3  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  34.83 
 
 		 204 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04050  predicted membrane protein  34.93 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.818037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  29.95 
 
 		 205 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  31.55 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  31.03 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  33.02 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  29.44 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  35.97 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  35.46 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  34.55 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  34.55 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  37.91 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  33.94 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  28 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  36.09 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  33.76 
 
 		 211 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  37.06 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2740  protein of unknown function UPF0126  31.98 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  29.95 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20420  predicted membrane protein  29.77 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  29.95 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  38.61 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  29.8 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  35.9 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  28.36 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  29.27 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  41.46 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  31.94 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  27.41 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  31.47 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  33.73 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  32.19 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  36.48 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  28.7 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  30.89 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18070  predicted membrane protein  29.6 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  38.04 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  31.45 
 
 		 219 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  31.9 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  27.8 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  36.22 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  30.69 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  23.65 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  34.43 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  36.27 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2223  hypothetical protein  31.35 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  32.66 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  26.76 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  30.85 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2399  protein of unknown function UPF0126  28.7 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.53799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  32.82 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.97 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.97 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.97 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.97 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  34.19 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  30.8 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  32.04 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  33.66 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  35.33 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  31.61 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  29.21 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  32.9 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  30.95 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  30.92 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  31.43 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  29.52 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  24.4 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  28.71 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  27.17 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  30.54 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  25.23 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>