More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1175 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  404  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2223  hypothetical protein  67.98 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0525  hypothetical protein  61.26 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3514  hypothetical protein  52.91 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.996987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  46.38 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  45 
 
 		 211 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  44.5 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  41.71 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  42.36 
 
 		 238 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  41.33 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  46.19 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  40.2 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  40.2 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  42.42 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  44.16 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  37.68 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  38.16 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  40.38 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  39.8 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  39.81 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  39.9 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  40.38 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  36.71 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  39.9 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  41.79 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  39.71 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  36.41 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  40.38 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  40.38 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  41.29 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  40.38 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  39.9 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  40.38 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  40.39 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  36.59 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  42.03 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  45.39 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  46.5 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  38.5 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  41.03 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  34.01 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  41.62 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  41.62 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  38.61 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  39.49 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1412  hypothetical protein  38.16 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  37.56 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  31.84 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  43.87 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  39.39 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  37.82 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  30.92 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  31.53 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  31.53 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  31.53 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  39.47 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  30.24 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0760  hypothetical protein  37.7 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  35.8 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  30.24 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  30.24 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  30.24 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  30.54 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  37.19 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  30.2 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.18 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  32.02 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  36.76 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  39.8 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  30.26 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  32.2 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  32.2 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  37.89 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  37.89 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  37.89 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  37.89 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  37.89 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  32.83 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  37.91 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31288  predicted protein  32.44 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00253453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  41.55 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  41.55 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  31.63 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  41.55 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  41.55 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  41.55 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  41.55 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  41.55 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  41.55 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  41.46 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  34.38 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  37.37 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  41.06 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  41.06 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  38.61 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  41.06 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  41.06 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  41.06 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  38.78 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  38.78 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>