More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4184 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  89.62 
 
 		 213 aa  342  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  66.67 
 
 		 209 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  67.68 
 
 		 209 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  52.2 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  51.71 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  53.96 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  51.26 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  49.76 
 
 		 218 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  52.88 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  48.06 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  49.27 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  48.06 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  48.21 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  47.09 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  42.72 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  47.45 
 
 		 204 aa  161  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  46.12 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0760  hypothetical protein  44.97 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  40.21 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  40.2 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  40.2 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  40.2 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  42.44 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  40.39 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  41.21 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  39.29 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  41.71 
 
 		 207 aa  144  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  39.2 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  38.69 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  38.69 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  38.69 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  39.9 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  39.71 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  38.69 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  37.69 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  39.8 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0525  hypothetical protein  44.12 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  37.04 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  37.04 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0500  hypothetical protein  41.98 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  35.08 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.29 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.29 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.29 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.29 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  38.38 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  40.51 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  33.86 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  34.47 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  37.88 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.9 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  38.54 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.55 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  38.69 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.03 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  34.03 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  34.03 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  35.98 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  37.44 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  40.53 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  34.72 
 
 		 208 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  37.68 
 
 		 246 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  39.8 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  39.11 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  36.41 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36.18 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  41.62 
 
 		 202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  36.59 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  33.68 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  34.98 
 
 		 208 aa  128  8.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  41.03 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  41.03 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  41.03 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  41.03 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  41.03 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  41.03 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  41.03 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  41.03 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  41.03 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  40.21 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  38.54 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  34.78 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  40.51 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  34.69 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  38.12 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  47.44 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  41.62 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  34.36 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  39.66 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2223  hypothetical protein  39.51 
 
 		 207 aa  122  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  38.73 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  33.51 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  38.81 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>