More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3616 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  63.37 
 
 		 207 aa  258  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0500  hypothetical protein  63.18 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  52.24 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  49.51 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  49.51 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  47.57 
 
 		 211 aa  177  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  47.09 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  50.24 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  48.04 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  50.75 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  43.81 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  45.15 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  48.26 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  48.26 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  44.39 
 
 		 204 aa  154  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  48.06 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  45.36 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  48.22 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0760  hypothetical protein  40.72 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  35.96 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  36.84 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  35.82 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1550  hypothetical protein  38.65 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  37.77 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  36.71 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  41.03 
 
 		 246 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  35.92 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  41.26 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  38.3 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  38.3 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  40.21 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  35.26 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.41 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  34.85 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  34.85 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  36.76 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  36.08 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  36.76 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  33.83 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  38.89 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  37.84 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  38.22 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  35.79 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  37.17 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  46.5 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33.96 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  36.02 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  37 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  34.74 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  33.65 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  37.7 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  35.94 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.27 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  36.14 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  33 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  37.37 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  36.41 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0525  hypothetical protein  40.87 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  33.84 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  33.84 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  34.67 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  33.84 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  33.84 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  38.97 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  31.66 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  43.14 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.93 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.45 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  34.45 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  38.97 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  38.97 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  38.97 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  38.97 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  38.97 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  33.84 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  36.76 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  34.01 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  33.84 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  34.01 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  34.01 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  34.01 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3514  hypothetical protein  39.53 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.996987 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  42.07 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  42.07 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  33.66 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  42.07 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0065  hypothetical protein  42.07 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0883885  hitchhiker  0.000264981 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  42.07 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  42.07 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  36.95 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  33.66 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  33.66 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>