More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0870 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  420  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  66.01 
 
 		 213 aa  258  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  50 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  48.98 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  52.2 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  49.48 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  52.2 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  52.2 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  52.2 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  52.2 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  52.2 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  51.57 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  45.41 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  51.57 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  47.69 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  48.21 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  48 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  44.44 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  49.06 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  49.06 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  49.06 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  49.06 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  49.06 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  49.06 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  45.45 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  49.06 
 
 		 207 aa  168  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  44.83 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  44.3 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  41.03 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  35.86 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  38.97 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  38.97 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  38.97 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  38.97 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  34.85 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  41.41 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  37.95 
 
 		 217 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  39.5 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  36.49 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  39.11 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  37.31 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  39.27 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  39.27 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  38.16 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  35.9 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  38.81 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  38.81 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  39.39 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  38.81 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.69 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  35.53 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  38.97 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  40.53 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  40.69 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  37.8 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  37.8 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  42.23 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  31.37 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  38.19 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  39.3 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  37.37 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  41.12 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  38 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  38 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  37.95 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  42.04 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  34.54 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  34.54 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  38.07 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  43.31 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  43.31 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  43.31 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  43.31 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  35.64 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  36.02 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  36.02 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3632  hypothetical protein  42.57 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  35.57 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  38.19 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  38.31 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.75 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  38.38 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  39.29 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  40.12 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  38.25 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  37 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  36.49 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  30 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  37.89 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  36.84 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  37.37 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>