More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2574 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  62.44 
 
 		 210 aa  245  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0500  hypothetical protein  59.62 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  46.6 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  46.12 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  46.12 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  43.96 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  43.48 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  46.12 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  43.48 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  43 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  42.72 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  42.72 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  44.44 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  40 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  37.56 
 
 		 238 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  37.31 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  40.62 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  35.68 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  34.18 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  35.78 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  40.91 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  36.1 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.36 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  35.35 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  35.35 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  39.6 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  35.18 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  35.18 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  37.69 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  36.18 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  39.18 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  34.31 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  36.59 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  31.79 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  35.78 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  34.65 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  38.22 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  38.22 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  37.2 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  34.8 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  37 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  43.87 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  39 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  38.38 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  33.82 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  35.29 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  39.11 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  33.67 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  32.84 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  32.84 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  34.31 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  32.84 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  35.5 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  33.67 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  35.35 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  35.35 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  35.35 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  36.87 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  32.47 
 
 		 217 aa  111  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  40.31 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  31.84 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  31.84 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  31.84 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  32.98 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  31.84 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  35.48 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  32.84 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  35 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  36.14 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  32.45 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  32.45 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  31.71 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  35 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  32.11 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  36.72 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  34.85 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  34.85 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0760  hypothetical protein  37.11 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  33.8 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  31.16 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  34.72 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  29.56 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  34.8 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  37.88 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  35.55 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  32.5 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  33.17 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  33.17 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  40.67 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  41.94 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  31.79 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  34.55 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  31.5 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  35.08 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>