More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4020 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  71.56 
 
 		 211 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  70.62 
 
 		 211 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  66.82 
 
 		 211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  72.3 
 
 		 211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  60.29 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  60.77 
 
 		 218 aa  248  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  60.77 
 
 		 218 aa  248  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  54.77 
 
 		 209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  53.85 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  50.25 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  55.1 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  52.88 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  52.88 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  51.94 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  45.93 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0500  hypothetical protein  48.79 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  51.04 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0525  hypothetical protein  45.6 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  42.63 
 
 		 204 aa  152  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3514  hypothetical protein  48.29 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.996987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  46.19 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2223  hypothetical protein  43 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  51.27 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1550  hypothetical protein  43.28 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156716  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  37.32 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  37.32 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  37.37 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0760  hypothetical protein  39.38 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  36.65 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  38 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  38.5 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  36.13 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  35.68 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  37.88 
 
 		 201 aa  121  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.67 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  34.67 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  34.67 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  31.58 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.17 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  35.61 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  36.23 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  39 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  33.99 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  33.99 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  33.99 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  33.99 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  36.18 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  38.35 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36.1 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  35.71 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  35.87 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  35.87 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  37.69 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.71 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  36.89 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  33.84 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  35.44 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  36.67 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  34.57 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  33.99 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.07 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  33.99 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  35.44 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  35.24 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  35.24 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  36.14 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  42.07 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  32.84 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  35.11 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  34.59 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  35.82 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  34.76 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  35.94 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  35.58 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  35.58 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  32.99 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  35.64 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  35.58 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  35.82 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  35.58 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  38.12 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  39.11 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  34.24 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  34.24 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  34.24 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1171  hypothetical protein  41.38 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.534638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  33 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  34.63 
 
 		 217 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  32.83 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  30.95 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  32.83 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  36.5 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  32.83 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  33.7 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  37.37 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  32.51 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>