More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4861 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0525  hypothetical protein  54.55 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  50.79 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  49.48 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  47.47 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  49.74 
 
 		 218 aa  174  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  49.74 
 
 		 218 aa  174  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  46.97 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  43.9 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  51.22 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2223  hypothetical protein  46.73 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  47.47 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3514  hypothetical protein  48.79 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.996987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  52.87 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  48.74 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  44.44 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  45.79 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0760  hypothetical protein  45.83 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  46.12 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  46.12 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  37 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  44.27 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  45.61 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  39.09 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  38.58 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  43.2 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  35.32 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  38.27 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  44.44 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  40.31 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  39.6 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  38.07 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  38.07 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  36.82 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  35.86 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  37.7 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  37.31 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  37.24 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  38.54 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  33.67 
 
 		 222 aa  114  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.32 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  34.07 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  34.33 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  36.5 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  34.54 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  34.62 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  33.66 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.62 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.55 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  35.32 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.62 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.62 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.62 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.62 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  36.87 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  35.23 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  34.54 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.62 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  34.62 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  34.62 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  32.68 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  37.19 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0500  hypothetical protein  42.29 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  35.05 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  34.01 
 
 		 208 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  35.15 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  33.51 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  35.15 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  34.98 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  35.35 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  34.01 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  34.95 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  34.78 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  37.56 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  32.84 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  32.84 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  32.84 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  32.84 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  32.84 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  40.74 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  32.8 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  32.8 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  33.87 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  34.33 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  35.96 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  32.26 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  32.26 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  32.26 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  32.26 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  35.32 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  32.31 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  34.72 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>