More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3482 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  400  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  46.97 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  47.98 
 
 
207 aa  178  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  43.22 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  47.98 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  47.98 
 
 
207 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  47.98 
 
 
207 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  47.98 
 
 
207 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  47.98 
 
 
207 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  47.98 
 
 
207 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  41.71 
 
 
215 aa  171  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  43.94 
 
 
206 aa  168  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  43.81 
 
 
207 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  43.43 
 
 
206 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  43.43 
 
 
206 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  42.93 
 
 
206 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  42.93 
 
 
206 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  42.93 
 
 
206 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  42.93 
 
 
206 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  43.43 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  42.93 
 
 
206 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  41.35 
 
 
207 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  40.87 
 
 
207 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  42.42 
 
 
207 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  44.83 
 
 
213 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  37.88 
 
 
205 aa  150  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  42.08 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  40.58 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  40.8 
 
 
205 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  41.06 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  37.31 
 
 
207 aa  134  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  37.93 
 
 
211 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  39.7 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  39.7 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  39.2 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  39.2 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  36.32 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  37.69 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  35.2 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  36.36 
 
 
202 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  34.54 
 
 
208 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  37.69 
 
 
203 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  37.69 
 
 
203 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  37.69 
 
 
203 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  35.05 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  35.29 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3632  hypothetical protein  41.95 
 
 
204 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  39 
 
 
208 aa  119  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  34.02 
 
 
208 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  36.14 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  34.02 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  32.99 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  35.68 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  37.69 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  38.19 
 
 
203 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  37.91 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  36.5 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  34.5 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  33.82 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  33.5 
 
 
201 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  36.76 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  34.5 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  36.76 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  35.15 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  37.06 
 
 
203 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  31.68 
 
 
208 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  38.07 
 
 
203 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  38.07 
 
 
203 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  38.07 
 
 
203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  31.96 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  31.96 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  33.66 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  35.96 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  35.38 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2200  hypothetical protein  33.49 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138246  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  34.02 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  34.2 
 
 
209 aa  112  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  31.68 
 
 
208 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  35.89 
 
 
208 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  37.56 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  35 
 
 
208 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.85 
 
 
203 aa  111  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  38.07 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  36.1 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  31.68 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  31.68 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  31.68 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  37.07 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  31.68 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  34.74 
 
 
217 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  38.05 
 
 
210 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  33.66 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  34.98 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.21 
 
 
213 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.21 
 
 
213 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.21 
 
 
213 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  32.84 
 
 
205 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  37.56 
 
 
203 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.21 
 
 
213 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>