More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2200 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2200  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138246  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  32.11 
 
 
207 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  30.77 
 
 
207 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  30.32 
 
 
207 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  33.49 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  31.88 
 
 
213 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  31.88 
 
 
213 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  31.88 
 
 
213 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  31.88 
 
 
213 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  31.88 
 
 
213 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  31.88 
 
 
213 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  31.4 
 
 
213 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  31.4 
 
 
213 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  29.95 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 
202 aa  108  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  32.6 
 
 
206 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  32.6 
 
 
206 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  32.6 
 
 
206 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  32.6 
 
 
206 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  32.16 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  32.16 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  29.2 
 
 
207 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  33.49 
 
 
213 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  31.72 
 
 
206 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  32.08 
 
 
206 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  32.08 
 
 
206 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  29.77 
 
 
215 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  31.13 
 
 
207 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  29.2 
 
 
207 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  31.88 
 
 
203 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  30.53 
 
 
206 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  30.92 
 
 
211 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  31.88 
 
 
203 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  31.31 
 
 
207 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  31.31 
 
 
207 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  35.75 
 
 
203 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  31.25 
 
 
209 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  31.25 
 
 
209 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  29.3 
 
 
213 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  30.84 
 
 
207 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  32.51 
 
 
208 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  36.36 
 
 
203 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  30.99 
 
 
207 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  30.99 
 
 
207 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  30.99 
 
 
207 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  32.37 
 
 
203 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  31.8 
 
 
208 aa  101  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  28.77 
 
 
207 aa  99  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  30.54 
 
 
208 aa  98.2  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  31.31 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  30.2 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  29.95 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  27.65 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  29.56 
 
 
211 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  95.9  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  34.3 
 
 
212 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  29.06 
 
 
208 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  32.02 
 
 
210 aa  95.1  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  31.73 
 
 
204 aa  95.1  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  31.05 
 
 
207 aa  95.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  28.02 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  32.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  32.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  28.44 
 
 
222 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  32.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  33.88 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  33.88 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  33.88 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  32.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  32.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0065  hypothetical protein  32.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0883885  hitchhiker  0.000264981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  33.88 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  32.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  33.88 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  32.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4149  hypothetical protein  32.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375876  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  30.19 
 
 
205 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  34.12 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  28.86 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  30.84 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  26.55 
 
 
206 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  26.98 
 
 
207 aa  92  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  30.35 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  26.98 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  31.34 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  32.35 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  30.85 
 
 
200 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  31.64 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>