More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12810 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  100 
 
 		 211 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  65.98 
 
 		 211 aa  254  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  62.11 
 
 		 219 aa  215  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  58.82 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  55.5 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  55.5 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  55.5 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  49.28 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  53.43 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  49.04 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  42.31 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  43.84 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  40.59 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.81 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  44.22 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  40.59 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  40.3 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  38 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  42.21 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  37.31 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  38.5 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  37 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  42.11 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  36.41 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  42.86 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  36.89 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  40.69 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  36.87 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  39.22 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  39.22 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  37.13 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  39.18 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  39.18 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  38.24 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  32.66 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  36.04 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  36.5 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  42.86 
 
 		 217 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  36.82 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  38.39 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  41.45 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  39.8 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  35.42 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  35.42 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  39.35 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  35.42 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  33.83 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  39.64 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  46.41 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  32.02 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  36.41 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  36.14 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  36.27 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  37.75 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  36.63 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  36.63 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  35.78 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  35.08 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  35.58 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  41.86 
 
 		 226 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  41.21 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  37.13 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  36.27 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  37.13 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  37.13 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  37.13 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  32.63 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  36.14 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  34.12 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  31.6 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  34.5 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  34.33 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  36.41 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  31.61 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  37.87 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  33.01 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  36.14 
 
 		 208 aa  98.6  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  38 
 
 		 303 aa  99  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1412  hypothetical protein  34.31 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  38.86 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  35.05 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  31.47 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  34 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1077  protein of unknown function UPF0126  40.82 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  34.47 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  31.73 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  31.73 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  30.81 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  28.35 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1034  hypothetical protein  37.07 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.859571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  37.84 
 
 		 242 aa  95.5  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  41.03 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  32.52 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  36.04 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>