More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1077 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1077  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 215 aa  407  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2268  hypothetical protein  69.08 
 
 		 205 aa  221  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.766024  hitchhiker  0.000226312 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  50.49 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  44.44 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  39.7 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  39.8 
 
 		 205 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  39.15 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  41.71 
 
 		 207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  40.21 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  37.68 
 
 		 206 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  38.81 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  37.8 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  38.32 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  39.61 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  38.32 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  35.35 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  38.71 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  34.47 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  36.41 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  40.1 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  39.8 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  39.8 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  40.61 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  41.5 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  37.06 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  37.5 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  39.8 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  40.7 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  41.33 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  34.2 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  39.8 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  39.8 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  40.51 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  40.51 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  40.62 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  40.62 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  40.51 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  40.51 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  40.62 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  37.32 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  41.41 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  39.09 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  32.96 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  40.45 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  36.59 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  37.38 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  41.12 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  37.13 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  38.58 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  35.2 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  38.78 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  34.62 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  33.74 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  39.15 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  38.58 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  38.97 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  36.71 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  39.38 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  38.73 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  42.36 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  40.94 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  35.64 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  30.85 
 
 		 205 aa  98.2  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  39.61 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  34.17 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  32.16 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  35.58 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  34.68 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  36.41 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  33.82 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  41.78 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  31.37 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  36.11 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  35.76 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  40.49 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  34.15 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  32.38 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  30.23 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  32.04 
 
 		 238 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  30.23 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  32.69 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  34.83 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  35.29 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  34.33 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  32.84 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  41.57 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  31.34 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1555  protein of unknown function UPF0126  34.62 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.283277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  34.36 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  37.29 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  39.04 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  37.91 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  35.92 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  35.29 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2180  hypothetical protein  32.69 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  34.31 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  34.31 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>