More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1926 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 230 aa  434  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  53.14 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  47.21 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  44.66 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  41.29 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  45.45 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  36.65 
 
 		 263 aa  148  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  50 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  43.22 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  46.5 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  37.98 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  39.29 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  44.85 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  39.44 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  39.25 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1387  protein of unknown function UPF0126  42.86 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.72 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  41.59 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  43.59 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  38.42 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  40.99 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  38.42 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.9 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.63 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  35.68 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  42.86 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  33.89 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  36.92 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  36.73 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  35.23 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  35.82 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  36.08 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  34.36 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  36.68 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  36.68 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  36.68 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  42 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  42 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  32.99 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  32.65 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  30.41 
 
 		 203 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  32.34 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  36.67 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  34.15 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  34.15 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  35.12 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  31.96 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  31.96 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  32.47 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  32.47 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  31.96 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  31.96 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  41.67 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  39.6 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  41.67 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  32.47 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  41.67 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  40.26 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  36.68 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  34.86 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  41.5 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  44.52 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  35.03 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  39.61 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  36.81 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  31.84 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  34.07 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  35 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  43.48 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  31.4 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  37.38 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  39.61 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  43.48 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  33.17 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  36 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  40.71 
 
 		 201 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  31.6 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  31.6 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  35.64 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  37.34 
 
 		 219 aa  98.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  41.73 
 
 		 207 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20420  predicted membrane protein  35.27 
 
 		 330 aa  97.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  32.32 
 
 		 213 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  36.41 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  40.91 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  30.69 
 
 		 317 aa  96.7  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  34.62 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  35 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  34.22 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  37.35 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  34.22 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  34.22 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  32 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  32.45 
 
 		 200 aa  95.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  33.68 
 
 		 211 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  34.16 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>