100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3001 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3001  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
635 aa  1199    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398908  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3023  putative GAF sensor protein  44.96 
 
 
469 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.593055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
912 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
1557 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.43 
 
 
585 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2483  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 
384 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
1084 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2395  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
384 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
1548 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0457  putative GAF sensor protein  35.5 
 
 
423 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0456  putative GAF sensor protein  35.5 
 
 
423 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0428  putative GAF sensor protein  34.91 
 
 
423 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1419 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
588 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2026  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 
964 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 
1070 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 
1070 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
735 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
1165 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
882 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
1330 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  35.36 
 
 
693 aa  72.4  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
1255 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
2161 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.03 
 
 
702 aa  71.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
695 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
707 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
1965 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  30.9 
 
 
709 aa  68.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  39.62 
 
 
1432 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 
2153 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  37.82 
 
 
502 aa  66.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
710 aa  65.1  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  43.42 
 
 
1039 aa  63.9  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 
719 aa  63.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
659 aa  61.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
1261 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
592 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 
1165 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
587 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.71 
 
 
843 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  50.94 
 
 
855 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2112  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.8 
 
 
836 aa  59.7  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
1014 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 
2783 aa  57.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.34 
 
 
688 aa  57.4  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  29.92 
 
 
1170 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  29.92 
 
 
1170 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.32 
 
 
697 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.18 
 
 
1480 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  37.61 
 
 
1225 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  29.03 
 
 
692 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  27.01 
 
 
584 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.3 
 
 
711 aa  54.3  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  32.12 
 
 
627 aa  54.7  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 
546 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1711 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.11 
 
 
672 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 
700 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
587 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 
647 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 
1672 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.28 
 
 
961 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.24 
 
 
957 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  35.79 
 
 
643 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
917 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
1227 aa  50.4  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 
543 aa  50.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
601 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  35.59 
 
 
713 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.12 
 
 
934 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  35.79 
 
 
594 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
1017 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
601 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
666 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0985  sensory box protein  32.45 
 
 
976 aa  48.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.928504  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0383  GAF domain protein  43.68 
 
 
316 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 
726 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  27.04 
 
 
743 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  33.07 
 
 
858 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.62 
 
 
860 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.62 
 
 
880 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  17.78 
 
 
1181 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  29.22 
 
 
757 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 
662 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.05 
 
 
3470 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.28 
 
 
803 aa  46.6  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
1284 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  29.29 
 
 
688 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
1184 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1611  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  25.39 
 
 
946 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.319418  normal  0.0964053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  22.72 
 
 
792 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 
718 aa  45.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  32.73 
 
 
548 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
781 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1411  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  40.43 
 
 
664 aa  44.3  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3737  hypothetical protein  30.87 
 
 
244 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  28.05 
 
 
550 aa  43.9  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
1741 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
780 aa  43.9  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>