98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0457 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0456  putative GAF sensor protein  99.53 
 
 		 423 aa  825    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0457  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 423 aa  828    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0428  putative GAF sensor protein  96.69 
 
 		 423 aa  781    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 1557 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1419 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  36.75 
 
 		 581 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 1184 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3001  putative PAS/PAC sensor protein  37.75 
 
 		 635 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 		 865 aa  81.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 709 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  33.78 
 
 		 721 aa  77  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 543 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  32.12 
 
 		 723 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 601 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 601 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 912 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.48 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 882 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3023  putative GAF sensor protein  29.48 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.593055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.17 
 
 		 585 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  33.14 
 
 		 956 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 		 765 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.45 
 
 		 860 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  34.91 
 
 		 760 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.73 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  28.32 
 
 		 754 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 1171 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  29.76 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  32.91 
 
 		 685 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4251  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 674 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 866 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 709 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 647 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.62 
 
 		 1478 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 		 1039 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  29.21 
 
 		 607 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  28.02 
 
 		 753 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.3 
 
 		 707 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  34.81 
 
 		 776 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 588 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.82 
 
 		 688 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  49.15 
 
 		 711 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 		 3470 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  25.93 
 
 		 574 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  39.68 
 
 		 688 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.14 
 
 		 553 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.03 
 
 		 702 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.89 
 
 		 743 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  38.2 
 
 		 1432 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 591 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 666 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.8 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  26.14 
 
 		 618 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 1043 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  33.13 
 
 		 583 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 662 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.96 
 
 		 583 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  34.88 
 
 		 800 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 592 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  29.61 
 
 		 562 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.39 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  27.51 
 
 		 817 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  33.67 
 
 		 692 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 1711 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 592 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.11 
 
 		 616 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 592 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.66 
 
 		 1480 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 592 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.4 
 
 		 579 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  26.37 
 
 		 697 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 545 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  26.2 
 
 		 932 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 572 aa  46.6  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  24.54 
 
 		 969 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  27.91 
 
 		 744 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  26.06 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  25.75 
 
 		 550 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 2783 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 711 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  26.98 
 
 		 730 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  22.81 
 
 		 697 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.55 
 
 		 491 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0292  PAS  29.5 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  22.69 
 
 		 636 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  28.24 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  25.93 
 
 		 585 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  23.64 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 726 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  24.7 
 
 		 693 aa  43.1  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  27.61 
 
 		 546 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>