105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3023 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3023  putative GAF sensor protein  100 
 
 
469 aa  892    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.593055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3001  putative PAS/PAC sensor protein  44.57 
 
 
635 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398908  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
912 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 
1084 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2483  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 
384 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
1165 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
1557 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2395  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
384 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
1548 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
1070 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
1070 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.57 
 
 
585 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0428  putative GAF sensor protein  36.51 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2026  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
964 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
735 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
695 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 
882 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0456  putative GAF sensor protein  35.45 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0457  putative GAF sensor protein  35.45 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
659 aa  71.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  30.94 
 
 
709 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
1330 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  43.75 
 
 
1225 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.06 
 
 
1480 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.85 
 
 
843 aa  66.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.14 
 
 
702 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  38.54 
 
 
1432 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  31.78 
 
 
1170 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  31.78 
 
 
1170 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
1255 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 
1419 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
588 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
1965 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
1711 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  31.43 
 
 
1165 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  50.94 
 
 
855 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
707 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
592 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
2153 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
2783 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
1527 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 
2161 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  28.02 
 
 
688 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
601 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.92 
 
 
1261 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  36.71 
 
 
1039 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  33.86 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
601 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.91 
 
 
961 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  29.02 
 
 
700 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.98 
 
 
711 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 
3470 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
1527 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
1184 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 
666 aa  53.5  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.25 
 
 
697 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  40.3 
 
 
692 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
1527 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.26 
 
 
957 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  29.23 
 
 
627 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
917 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  41.79 
 
 
693 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
710 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  21.75 
 
 
1183 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
1672 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.62 
 
 
775 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
906 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  29.52 
 
 
688 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2112  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.26 
 
 
836 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
1181 aa  48.5  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  29.7 
 
 
643 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  24.63 
 
 
392 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
934 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 
594 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
780 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 
540 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.69 
 
 
797 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
587 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  31.49 
 
 
591 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  33.86 
 
 
858 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  27.2 
 
 
758 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1411  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  34.69 
 
 
664 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.99 
 
 
2031 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
718 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.38 
 
 
1332 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  38.18 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  38.18 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  38.18 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  38.18 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  38.18 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.29 
 
 
1287 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
646 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.4 
 
 
792 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
780 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2869  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  38.64 
 
 
648 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.990966 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5265  cGMP-specific and -stimulated phosphodiesterase/adenylate cyclase  38.18 
 
 
324 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
523 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
516 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 
803 aa  43.9  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2107  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  24.61 
 
 
617 aa  43.5  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00105125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>