More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0751 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0751  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
231 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.17 
 
 
584 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.82 
 
 
596 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.9 
 
 
605 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  34.2 
 
 
352 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.92 
 
 
594 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.92 
 
 
594 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  31.65 
 
 
590 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.48 
 
 
766 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.79 
 
 
797 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  32.3 
 
 
601 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  31.17 
 
 
590 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  35.56 
 
 
428 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1913  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 
720 aa  98.2  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  35.56 
 
 
428 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2231  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.19 
 
 
699 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  31.86 
 
 
582 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  31.03 
 
 
306 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.4 
 
 
585 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.4 
 
 
585 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.25 
 
 
786 aa  95.9  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.4 
 
 
585 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  34.67 
 
 
428 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  30.6 
 
 
379 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.4 
 
 
585 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.52 
 
 
584 aa  95.5  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.03 
 
 
883 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0960  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.05 
 
 
774 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.150868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  30.53 
 
 
357 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2057  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.34 
 
 
699 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  34.09 
 
 
425 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  32.76 
 
 
371 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.96 
 
 
583 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3652  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.44 
 
 
656 aa  93.2  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.96 
 
 
583 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  33.03 
 
 
424 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  32.19 
 
 
357 aa  92.4  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4726  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.47 
 
 
676 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0452393  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  33.78 
 
 
428 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0122  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.96 
 
 
515 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.907666  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  33.78 
 
 
428 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  33.78 
 
 
428 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1980  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.43 
 
 
779 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.230064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  30.7 
 
 
356 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.51 
 
 
753 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0335  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.57 
 
 
789 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5143  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.42 
 
 
884 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663755  normal  0.026538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  29.52 
 
 
584 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 
423 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.84 
 
 
572 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4279  diguanylate phosphodiesterase  32.07 
 
 
936 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  33.78 
 
 
422 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3635  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.44 
 
 
656 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0108  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.57 
 
 
594 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0509373  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0207  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.14 
 
 
536 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155784  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1491  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.76 
 
 
641 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0951  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  28.97 
 
 
399 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3642  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.59 
 
 
526 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1813  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.94 
 
 
777 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.223015  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0286  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.6 
 
 
707 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  27.39 
 
 
734 aa  89  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1312  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.94 
 
 
776 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3586  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.97 
 
 
442 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0891  GGDEF family protein  31.28 
 
 
433 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 
464 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  32.89 
 
 
515 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0430  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.74 
 
 
449 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.38 
 
 
633 aa  88.2  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 
464 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.44 
 
 
700 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133326  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.74 
 
 
611 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.52 
 
 
584 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  30.97 
 
 
880 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785469  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3076  diguanylate phosphodiesterase  33.04 
 
 
285 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2227  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.06 
 
 
698 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330245  normal  0.58075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  32.89 
 
 
429 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0583  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.7 
 
 
743 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.48 
 
 
794 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.587364  normal  0.017359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5159  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.88 
 
 
750 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0655785  normal  0.0151156 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.14 
 
 
790 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  26.43 
 
 
263 aa  86.3  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0618  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.64 
 
 
642 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  28.88 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0308  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.59 
 
 
541 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  31.51 
 
 
403 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  31.51 
 
 
403 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1280  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.11 
 
 
818 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  31.51 
 
 
427 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  32.88 
 
 
427 aa  85.9  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.55 
 
 
773 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  29.26 
 
 
651 aa  85.9  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3335  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.58 
 
 
786 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.874837  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.92 
 
 
779 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  28.38 
 
 
249 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2272  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.92 
 
 
779 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2712  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.48 
 
 
793 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2375  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.33 
 
 
790 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1742  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.33 
 
 
790 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2354  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.33 
 
 
790 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1209  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.58 
 
 
784 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>