More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0565 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  77.96 
 
 
424 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  82.7 
 
 
423 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  100 
 
 
515 aa  1035    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  85.75 
 
 
428 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  85.98 
 
 
428 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  95.34 
 
 
429 aa  820    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  99.78 
 
 
464 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  80.9 
 
 
425 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  99.35 
 
 
464 aa  927    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  85.98 
 
 
428 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  80.33 
 
 
422 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  85.18 
 
 
428 aa  736    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  84.91 
 
 
428 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  85.98 
 
 
428 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  50.91 
 
 
424 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  50.91 
 
 
424 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  49.87 
 
 
424 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  49.87 
 
 
424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  49.87 
 
 
424 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  49.61 
 
 
424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  49.61 
 
 
424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  49.35 
 
 
424 aa  343  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  49.1 
 
 
422 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  49.1 
 
 
424 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  49.1 
 
 
424 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  49.1 
 
 
422 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  49.1 
 
 
422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  49.1 
 
 
422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  48.31 
 
 
436 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  48.05 
 
 
436 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  45 
 
 
424 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3070  hypothetical protein  96.47 
 
 
171 aa  329  9e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0109  hypothetical protein  96.47 
 
 
171 aa  329  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00195405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2024  hypothetical protein  96.47 
 
 
171 aa  329  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2261  hypothetical protein  96.47 
 
 
171 aa  329  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  46 
 
 
419 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  41.3 
 
 
427 aa  306  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  43.29 
 
 
428 aa  296  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  41.49 
 
 
441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  41.77 
 
 
429 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  33.16 
 
 
428 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  38.64 
 
 
403 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  38.64 
 
 
427 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  38.64 
 
 
403 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  39.07 
 
 
411 aa  246  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  37.34 
 
 
424 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  38.52 
 
 
426 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.88 
 
 
780 aa  239  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  37.53 
 
 
421 aa  239  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  39.35 
 
 
426 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  39.35 
 
 
426 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  37.02 
 
 
427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  37.79 
 
 
446 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  38.52 
 
 
426 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  38.27 
 
 
426 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  37.79 
 
 
440 aa  233  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  38.85 
 
 
447 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.55 
 
 
790 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  38.25 
 
 
423 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.4 
 
 
777 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  47.19 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  47.19 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  47.19 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  30.32 
 
 
414 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  28.4 
 
 
413 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  32.32 
 
 
431 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000218  diguanylate phosphodiesterase  38.46 
 
 
272 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  30.37 
 
 
360 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  30 
 
 
362 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  27.69 
 
 
396 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0662  putative signaling protein  31.93 
 
 
266 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260634  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  36.21 
 
 
197 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  36.52 
 
 
272 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.76 
 
 
584 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  31.76 
 
 
584 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.76 
 
 
583 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.76 
 
 
583 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  32.01 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.2 
 
 
581 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.33 
 
 
585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.33 
 
 
585 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  32.14 
 
 
584 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.33 
 
 
585 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.33 
 
 
585 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.98 
 
 
584 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31 
 
 
632 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  33.61 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.02 
 
 
572 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  33.19 
 
 
351 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.12 
 
 
773 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.7 
 
 
766 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  32.17 
 
 
416 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.26 
 
 
584 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.7 
 
 
883 aa  115  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.6 
 
 
580 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.18 
 
 
590 aa  114  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  29.13 
 
 
263 aa  114  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  34.96 
 
 
601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3972  diguanylate phosphodiesterase  29.18 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  34.96 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>