More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0243 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0243  amidase  100 
 
 		 389 aa  760    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  45.56 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  44.04 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  38.58 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  45.26 
 
 		 394 aa  226  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  38.32 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  42.29 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  38.48 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  40.96 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  41.13 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  37.76 
 
 		 576 aa  212  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  39.29 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  38.92 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  41.53 
 
 		 546 aa  209  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  40.05 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  39.39 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  37.57 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  38.81 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  38.52 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.94 
 
 		 535 aa  192  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  34.58 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  37.77 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  37.77 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  42.2 
 
 		 579 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  37.23 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  41.11 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  32.7 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  34.33 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  40.75 
 
 		 364 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  35.58 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  35.01 
 
 		 449 aa  156  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  36.53 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  35.53 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  33.6 
 
 		 447 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  37.47 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  37.67 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  35.16 
 
 		 413 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  36.94 
 
 		 450 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.74 
 
 		 457 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  33.87 
 
 		 449 aa  142  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.95 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  28.72 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  37.34 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  33.7 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  34.33 
 
 		 422 aa  139  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  33.33 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  33.86 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  33.86 
 
 		 446 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  33.42 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  33.24 
 
 		 449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  35.2 
 
 		 437 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  32.66 
 
 		 462 aa  135  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  30.59 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  32.62 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.04 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  33.42 
 
 		 450 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  34.38 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  34.67 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  31.54 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  32.17 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  32.9 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  33.6 
 
 		 449 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  28.75 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  33.86 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  40.57 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  32.04 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  33.6 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.84 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  32.9 
 
 		 452 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0903  amidase  32.55 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00690645  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  29.21 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  32.55 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4364  amidase  32.01 
 
 		 471 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000480403  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  36.75 
 
 		 453 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  31.36 
 
 		 459 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  35.79 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  35.53 
 
 		 448 aa  123  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.62 
 
 		 485 aa  122  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  30.4 
 
 		 425 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  29.79 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  32.47 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  32.1 
 
 		 454 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  45.68 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.04 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  36.97 
 
 		 435 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.14 
 
 		 475 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  35.81 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  29.92 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  31.65 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  33.92 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  33.52 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  29.21 
 
 		 470 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  30.92 
 
 		 470 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  33.51 
 
 		 452 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.89 
 
 		 486 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  33.33 
 
 		 460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  30.95 
 
 		 549 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  33.24 
 
 		 451 aa  116  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  31.73 
 
 		 466 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  34.74 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>