More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3155 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3155  amidase  100 
 
 
364 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  41.94 
 
 
391 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  39.95 
 
 
405 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  41.13 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  40.86 
 
 
401 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  39.47 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  42.21 
 
 
399 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  40.76 
 
 
405 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  39.4 
 
 
395 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  39.89 
 
 
408 aa  195  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  42.47 
 
 
389 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  38.4 
 
 
400 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  43.43 
 
 
394 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  38.13 
 
 
395 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  36.39 
 
 
576 aa  190  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  35.36 
 
 
392 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  42.2 
 
 
393 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  41.48 
 
 
535 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  36.31 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  40.22 
 
 
393 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  33.42 
 
 
398 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  37.53 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  40.37 
 
 
546 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  38.04 
 
 
423 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  37.61 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  40.79 
 
 
399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  41.5 
 
 
579 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  38.03 
 
 
396 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  37.5 
 
 
379 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  47.93 
 
 
449 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  36.36 
 
 
447 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  38.21 
 
 
369 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  29.19 
 
 
411 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  30.58 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  32.9 
 
 
449 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  35.84 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  48.41 
 
 
457 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  51.77 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  31.06 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  32.82 
 
 
449 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.99 
 
 
374 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.18 
 
 
458 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  36.36 
 
 
377 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  31.79 
 
 
459 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  32.37 
 
 
449 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  29.95 
 
 
423 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  30.89 
 
 
463 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  33.24 
 
 
446 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  45.81 
 
 
464 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  31.2 
 
 
447 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  36.34 
 
 
374 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  36.03 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  51.05 
 
 
460 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  31.64 
 
 
457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  47.89 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  37.36 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  42.86 
 
 
456 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  43.95 
 
 
440 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  32.45 
 
 
446 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  49.32 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  31.05 
 
 
449 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  46.48 
 
 
456 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  38 
 
 
601 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  32.78 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  31.85 
 
 
442 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  31.94 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  30.73 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  51.06 
 
 
450 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.68 
 
 
485 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.86 
 
 
475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0746  amidase  33.97 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  29.29 
 
 
443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.16 
 
 
485 aa  116  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  34.02 
 
 
467 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  44.85 
 
 
453 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  35.18 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  32.75 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  35.75 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  32.75 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  43.04 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  32.75 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  37.27 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  32.75 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  32 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  43.66 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  32.75 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  32.49 
 
 
454 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  32.75 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  32.87 
 
 
440 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  33.33 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4592  amidase  35.53 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317108  normal  0.0439274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  39.74 
 
 
475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  45.22 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3612  amidase  34.9 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  33.97 
 
 
445 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.65 
 
 
480 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0320  pyrazinamidase/nicotinamidase  48.99 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  35.45 
 
 
599 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  50.34 
 
 
458 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  50.34 
 
 
458 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>