More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2503 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  100 
 
 		 374 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3612  amidase  94.51 
 
 		 374 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3908  amidase  94.23 
 
 		 374 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  89.29 
 
 		 374 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  90.11 
 
 		 374 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5086  amidase  88.67 
 
 		 374 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  72.25 
 
 		 374 aa  484  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  72.8 
 
 		 374 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0320  pyrazinamidase/nicotinamidase  75.69 
 
 		 375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  55.83 
 
 		 379 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  54.79 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  49.72 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  49.06 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0746  amidase  51.48 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  36.05 
 
 		 447 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  36.48 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  37.27 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  34.59 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  33.61 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  35.73 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.1 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  35.08 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  35.51 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.21 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.55 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  37.37 
 
 		 463 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.49 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.16 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  35.87 
 
 		 401 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  34.04 
 
 		 400 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  34.07 
 
 		 476 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.25 
 
 		 470 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2208  amidase  32.85 
 
 		 511 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  33.59 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  32.79 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  37.23 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.92 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.24 
 
 		 486 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  31.87 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5981  amidase  36.83 
 
 		 468 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0693963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2421  amidase  32.08 
 
 		 511 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0857  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.91 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.93 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  35.89 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  36.6 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  34.3 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.29 
 
 		 464 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  34.74 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1194  Amidase  38.19 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0374201  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.25 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  33.16 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.2 
 
 		 485 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.9 
 
 		 479 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  32.53 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  35.98 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7392  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.87 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  32.34 
 
 		 466 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  36.36 
 
 		 457 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2843  Amidase  31.07 
 
 		 503 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.942957  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3028  amidase  33.5 
 
 		 467 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0772  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.17 
 
 		 433 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.630554  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0208  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.9 
 
 		 453 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.382536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.92 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  33.69 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.32 
 
 		 480 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  35.58 
 
 		 467 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  45.37 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  36.46 
 
 		 416 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  33.66 
 
 		 511 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.01 
 
 		 485 aa  136  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  33.25 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  36.77 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  36.72 
 
 		 467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1547  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.25 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.93 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  36.72 
 
 		 467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.66 
 
 		 486 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.01 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  37.04 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  34.33 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.87 
 
 		 518 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00466527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.54 
 
 		 479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  36.3 
 
 		 389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  37.04 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  46.08 
 
 		 456 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  37.04 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  37.04 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  31.32 
 
 		 465 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  37.04 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  35.01 
 
 		 453 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  32.38 
 
 		 457 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  34.92 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.85 
 
 		 488 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1499  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.75 
 
 		 472 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000099116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.94 
 
 		 485 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  31.82 
 
 		 391 aa  132  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  33.86 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  33.77 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  48.15 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  33.51 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>