More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4367 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  100 
 
 
416 aa  783    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  36.64 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  38.82 
 
 
449 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  40.22 
 
 
457 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  36.98 
 
 
463 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  42.17 
 
 
451 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  38.3 
 
 
440 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  36.95 
 
 
450 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  37.37 
 
 
449 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  37.63 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  39.42 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  41.13 
 
 
447 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  38.6 
 
 
449 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  36.71 
 
 
456 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  38.18 
 
 
440 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  40.05 
 
 
427 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  38.1 
 
 
457 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  37.09 
 
 
469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  38.06 
 
 
437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  35.85 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  37.14 
 
 
459 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  37.02 
 
 
413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  41.76 
 
 
453 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  38.13 
 
 
453 aa  162  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  40.67 
 
 
454 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  38.63 
 
 
447 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  42.27 
 
 
369 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.84 
 
 
461 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.38 
 
 
470 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  36.14 
 
 
456 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  41 
 
 
457 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  37.29 
 
 
388 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  37.95 
 
 
432 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  30.77 
 
 
470 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.83 
 
 
463 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  38.34 
 
 
395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  38.68 
 
 
450 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  37.74 
 
 
448 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  38.65 
 
 
458 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  37.76 
 
 
400 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  37.82 
 
 
453 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.77 
 
 
463 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  39.38 
 
 
435 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  36.53 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  39.56 
 
 
546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  38.5 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  44.12 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  41.94 
 
 
455 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  34.51 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  39.64 
 
 
458 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  34.47 
 
 
452 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  36.34 
 
 
408 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  41.47 
 
 
435 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  34.17 
 
 
456 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0746  amidase  41.69 
 
 
382 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  43.75 
 
 
458 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  43.75 
 
 
458 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  37.98 
 
 
446 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  36.81 
 
 
446 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  38.44 
 
 
403 aa  143  6e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  44.9 
 
 
462 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.98 
 
 
480 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  36.32 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0822  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.88 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.578935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  43 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  36.59 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  35.88 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  34.31 
 
 
386 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  36.32 
 
 
457 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  43.38 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4787  Amidase  40.91 
 
 
516 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  35.9 
 
 
457 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  36.75 
 
 
407 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  36.57 
 
 
445 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3028  amidase  32.84 
 
 
467 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  32.11 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  43 
 
 
481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  37.7 
 
 
461 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  39.48 
 
 
452 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.25 
 
 
426 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  38.67 
 
 
377 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0756  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.3 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  38.16 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3243  amidase  36.01 
 
 
474 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  33.49 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  35.6 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  34.32 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  32.88 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2360  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.52 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.100992  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.64 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0989  amidase  34.04 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  31.22 
 
 
447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.53 
 
 
475 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  36.21 
 
 
467 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  42.65 
 
 
458 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  36.21 
 
 
467 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  36.21 
 
 
467 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  36.21 
 
 
454 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  43.75 
 
 
458 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  36.21 
 
 
467 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>