More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2934 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2934  amidase  100 
 
 		 450 aa  901    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  72.54 
 
 		 449 aa  646    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  73.88 
 
 		 463 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  71.88 
 
 		 449 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  73.67 
 
 		 449 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  67.59 
 
 		 449 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  66.28 
 
 		 449 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  64.8 
 
 		 447 aa  502  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  60.47 
 
 		 453 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  52.69 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  54.32 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  51.25 
 
 		 440 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  50.34 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  49.09 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  54.32 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  55.15 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  53.44 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  51.54 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  53.44 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  53.44 
 
 		 616 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  53.44 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  53.44 
 
 		 616 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  53.32 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  53.44 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  53.44 
 
 		 616 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  50.55 
 
 		 448 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  53.56 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  52.63 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  52.63 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  53.32 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  52.75 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  53.09 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  52.63 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  52.63 
 
 		 458 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  50.66 
 
 		 457 aa  352  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  46.64 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  50 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  47.64 
 
 		 450 aa  336  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  50.92 
 
 		 481 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  48.67 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  43.71 
 
 		 457 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  45.98 
 
 		 448 aa  316  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  46.21 
 
 		 448 aa  316  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  48.83 
 
 		 453 aa  315  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  48.21 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  43.61 
 
 		 469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  46.32 
 
 		 413 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  42.61 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  47.61 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  39.91 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  44.16 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  43.01 
 
 		 456 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  40.84 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  39.17 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  40.28 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  44.03 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  38.57 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  49.07 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  39.47 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  34.22 
 
 		 447 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  36.85 
 
 		 457 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  38.98 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  40.46 
 
 		 437 aa  233  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  40.37 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  38.11 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  48.85 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  39.74 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  38.7 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  35.38 
 
 		 407 aa  199  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  36.18 
 
 		 465 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  38.57 
 
 		 441 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  36.39 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  36.39 
 
 		 441 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  35.99 
 
 		 443 aa  189  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.8 
 
 		 467 aa  186  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  34.46 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  35.32 
 
 		 468 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  37.92 
 
 		 477 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  35.46 
 
 		 463 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  31.62 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  32.47 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  34.56 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.21 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0989  amidase  33.65 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.92 
 
 		 495 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  33.33 
 
 		 463 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  34.34 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  30.8 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  34.41 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0836  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.56 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0318775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  36.08 
 
 		 475 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  32.62 
 
 		 471 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  33.99 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.19 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  31.28 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.9 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  39.26 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.98 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.35 
 
 		 486 aa  156  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>