More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1721 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  100 
 
 		 427 aa  815    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  67.37 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  68.4 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  53.63 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  56.02 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  47.43 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  46.53 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  48.71 
 
 		 449 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  47.32 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  48.97 
 
 		 450 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  48.15 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  49.27 
 
 		 407 aa  322  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  47.78 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  45.41 
 
 		 459 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  45.67 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  48.05 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  48.15 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  46.52 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  45.12 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  53 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  46.1 
 
 		 456 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  45.67 
 
 		 457 aa  289  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  50.52 
 
 		 451 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  46.88 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  47.95 
 
 		 453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  50 
 
 		 450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  47.26 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  49.43 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  48.56 
 
 		 448 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  49.54 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  44.37 
 
 		 440 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  48.7 
 
 		 452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  49.43 
 
 		 458 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  47.94 
 
 		 458 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  47.94 
 
 		 458 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  45.22 
 
 		 469 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  50.8 
 
 		 458 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  49.74 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  44.44 
 
 		 413 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  44.71 
 
 		 449 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  44.07 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  47.94 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  48.86 
 
 		 472 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  48.86 
 
 		 472 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  48.86 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  48.86 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  48.86 
 
 		 616 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  48.86 
 
 		 616 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  48.86 
 
 		 616 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  48.97 
 
 		 476 aa  259  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  48.51 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  44.76 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  47.69 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  43.88 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  46.95 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  38.88 
 
 		 423 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  44.94 
 
 		 448 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  44.72 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  42.13 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  41.63 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  41.44 
 
 		 442 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  42.59 
 
 		 441 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  43 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  47.56 
 
 		 481 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  42.35 
 
 		 457 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  42.72 
 
 		 441 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  42.72 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  42.05 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  42.05 
 
 		 446 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  43.28 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  37.6 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  39.85 
 
 		 443 aa  210  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  43.94 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  41.1 
 
 		 460 aa  206  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  40.53 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  39.95 
 
 		 443 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.76 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  39 
 
 		 468 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  39.61 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  36.86 
 
 		 467 aa  186  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  39.26 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.57 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.43 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  40.84 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  40.11 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  39.53 
 
 		 422 aa  177  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  35.73 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1318  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.97 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  37.26 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.75 
 
 		 470 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  35.08 
 
 		 466 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  33.71 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  38.81 
 
 		 461 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  35.96 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  36.18 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0220  amidohydrolase, AtzE family  39.1 
 
 		 454 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  34.32 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  39.39 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.05 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  33.87 
 
 		 597 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>