More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2027 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  100 
 
 
475 aa  913    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  45.48 
 
 
459 aa  313  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  45.48 
 
 
442 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  44.94 
 
 
457 aa  299  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  41.86 
 
 
456 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  44.53 
 
 
456 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  42.72 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  39.47 
 
 
447 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  38.24 
 
 
456 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  39.96 
 
 
447 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  37.5 
 
 
449 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  40.23 
 
 
477 aa  209  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  38.53 
 
 
450 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  39.8 
 
 
449 aa  206  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  37.38 
 
 
463 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  38.12 
 
 
457 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  37.73 
 
 
449 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  39.19 
 
 
449 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  33.85 
 
 
423 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  41.22 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  37.03 
 
 
452 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  38.6 
 
 
449 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  38.68 
 
 
449 aa  193  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  35.8 
 
 
450 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  37.91 
 
 
469 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  40.47 
 
 
457 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  38.61 
 
 
448 aa  190  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  39.22 
 
 
453 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  38.58 
 
 
446 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  38.58 
 
 
446 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  36.95 
 
 
451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  35.96 
 
 
440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  38.24 
 
 
458 aa  183  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  38.53 
 
 
451 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  34.39 
 
 
443 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  36.76 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  38.53 
 
 
462 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  41.54 
 
 
458 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  39.6 
 
 
457 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  37.17 
 
 
467 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  36.03 
 
 
452 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  34.59 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  40.35 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  39.65 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  39.65 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  39.82 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  37.85 
 
 
413 aa  174  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  36.67 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  37.75 
 
 
453 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  37.61 
 
 
454 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  42.42 
 
 
435 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  37.61 
 
 
467 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  37.61 
 
 
467 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  37.39 
 
 
467 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  37.61 
 
 
467 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  37.39 
 
 
467 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  40.6 
 
 
458 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  37.17 
 
 
467 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  37.89 
 
 
447 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  36.64 
 
 
461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  38.32 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.54 
 
 
480 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  35.28 
 
 
465 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  32.68 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  34.8 
 
 
457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  39 
 
 
616 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  39 
 
 
616 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  39 
 
 
616 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  33.96 
 
 
446 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  39 
 
 
458 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  39 
 
 
472 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  39 
 
 
458 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  39 
 
 
472 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  39.9 
 
 
459 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  37.68 
 
 
435 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  39.65 
 
 
458 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  39.65 
 
 
458 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  37.5 
 
 
453 aa  160  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  35.37 
 
 
441 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  34.62 
 
 
460 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  38.02 
 
 
422 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3235  amidase  35.7 
 
 
488 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0114439  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  36.89 
 
 
448 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  35.44 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3176  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.57 
 
 
500 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  36.38 
 
 
441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  32.66 
 
 
407 aa  153  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.14 
 
 
470 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  35.48 
 
 
601 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  35.44 
 
 
436 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  36.3 
 
 
448 aa  151  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.67 
 
 
467 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.84 
 
 
491 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.13 
 
 
475 aa  149  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.79 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.33 
 
 
464 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  37.94 
 
 
481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.19 
 
 
483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.07 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  31.64 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>