More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3235 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3235  amidase  100 
 
 
488 aa  983    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0114439  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  55.97 
 
 
466 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3059  amidase  36.94 
 
 
473 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477089  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  34.36 
 
 
510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  37.03 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  36.42 
 
 
500 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  37.06 
 
 
484 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8287  indole acetimide hydrolase  29.8 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1011  indole acetimide hydrolase  36.55 
 
 
484 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0836853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.21 
 
 
463 aa  207  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3739  Amidase  33.4 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.38 
 
 
463 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  33.5 
 
 
455 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1537  amidase  34.78 
 
 
446 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.108403 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  33.05 
 
 
446 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.92 
 
 
480 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  33.48 
 
 
467 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58180  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.71 
 
 
484 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0418  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.12 
 
 
499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0118613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5097  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.09 
 
 
484 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.32 
 
 
483 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  32.19 
 
 
467 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.1 
 
 
483 aa  182  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.11 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.43 
 
 
499 aa  181  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  32.26 
 
 
467 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  32.12 
 
 
454 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  32.26 
 
 
467 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  32.26 
 
 
467 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.17 
 
 
441 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  32.04 
 
 
467 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.98 
 
 
484 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.45 
 
 
475 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  31.85 
 
 
467 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  34.5 
 
 
599 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_1318  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.74 
 
 
502 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.69 
 
 
485 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.66 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.35 
 
 
483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  33.55 
 
 
599 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.61 
 
 
489 aa  174  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.2 
 
 
484 aa  173  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.64 
 
 
495 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10590  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.7 
 
 
503 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.701412  normal  0.20971 
 
 
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NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.69 
 
 
479 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.55 
 
 
485 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
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NC_008346  Swol_0373  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.22 
 
 
487 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0268901  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  36.21 
 
 
447 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2947  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.58 
 
 
487 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0258  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.13 
 
 
485 aa  170  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  33.05 
 
 
601 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.1 
 
 
498 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0836  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.26 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0318775  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  33.92 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.89 
 
 
461 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  33.41 
 
 
470 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.59 
 
 
485 aa  167  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.6 
 
 
512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1714  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.2 
 
 
504 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
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NC_010644  Emin_0068  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.96 
 
 
474 aa  166  9e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.82 
 
 
488 aa  166  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4474  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.88 
 
 
483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0854  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.81 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  33.94 
 
 
447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.99 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2896  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.53 
 
 
488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  35.12 
 
 
457 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.95 
 
 
486 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4165  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.09 
 
 
483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  31.34 
 
 
459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.39 
 
 
494 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1935  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.82 
 
 
486 aa  163  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186595  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.87 
 
 
486 aa  163  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1245  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.26 
 
 
490 aa  163  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  31.63 
 
 
458 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.5 
 
 
491 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.85 
 
 
489 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.65 
 
 
481 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.74 
 
 
500 aa  162  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  34.47 
 
 
425 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.66 
 
 
486 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3436  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.13 
 
 
506 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  34.27 
 
 
449 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.67 
 
 
475 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  31.67 
 
 
456 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  31.06 
 
 
477 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.89 
 
 
485 aa  160  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  34.32 
 
 
467 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.35 
 
 
486 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.5 
 
 
463 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  42.98 
 
 
464 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.89 
 
 
487 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.24 
 
 
485 aa  159  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4284  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.95 
 
 
483 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009720  Xaut_3926  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.71 
 
 
494 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236708  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  31.55 
 
 
466 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
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NC_002947  PP_0931  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 
483 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.622396 
 
 
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NC_013530  Xcel_2394  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.87 
 
 
516 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225489  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  31.44 
 
 
423 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
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NC_008541  Arth_1307  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.66 
 
 
525 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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