More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3739 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3739  Amidase  100 
 
 		 446 aa  919    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  65.32 
 
 		 446 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1537  amidase  58.43 
 
 		 446 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.108403 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8287  indole acetimide hydrolase  33.26 
 
 		 462 aa  219  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  33.33 
 
 		 500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  33.99 
 
 		 455 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  33.76 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3059  amidase  33.69 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477089  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3235  amidase  33.4 
 
 		 488 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0114439  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  34.48 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  33.83 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  30.53 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  33.49 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  32.83 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  32.83 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  32.83 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  32.83 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  32.58 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  32.58 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  32.58 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  33.25 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.91 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1011  indole acetimide hydrolase  33.25 
 
 		 484 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0836853 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  27.8 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  32.97 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  30.47 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  29.44 
 
 		 458 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  29.85 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0731  amidase  35.09 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.0567025 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.45 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.66 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  28.27 
 
 		 481 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  30.57 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  29.72 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1933  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.41 
 
 		 474 aa  143  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.129092  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  31.98 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.92 
 
 		 495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  29.13 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  31.12 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  30.44 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.98 
 
 		 475 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  28.76 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  32.52 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  29.49 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  29.09 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  28.3 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  29.5 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  29.08 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  30.31 
 
 		 447 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  39.9 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  30.46 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  44.86 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0346  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.6 
 
 		 482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0113738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  30.19 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  31.82 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.63 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  27.48 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0869  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  27.62 
 
 		 481 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0362034 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.78 
 
 		 483 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  28.86 
 
 		 423 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  30.87 
 
 		 450 aa  133  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  29.05 
 
 		 607 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  30.37 
 
 		 437 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.31 
 
 		 482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  31.44 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  28.63 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.33 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  28.23 
 
 		 526 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  29.65 
 
 		 601 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  29.92 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  29.72 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  29.55 
 
 		 449 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  29.91 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  38.43 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  30.91 
 
 		 599 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.11 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  28 
 
 		 472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  30.3 
 
 		 599 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1245  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.05 
 
 		 490 aa  127  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  30.04 
 
 		 468 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1739  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.12 
 
 		 471 aa  126  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  29.43 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  35.9 
 
 		 519 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0756  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.08 
 
 		 431 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  28.74 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  29.95 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  34 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.46 
 
 		 485 aa  126  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.1 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  28.9 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.72 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  40 
 
 		 403 aa  124  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  29.43 
 
 		 546 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1007  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.61 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0638  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.34 
 
 		 494 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.87 
 
 		 497 aa  123  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.23 
 
 		 475 aa  123  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1694  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.06 
 
 		 487 aa  123  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  27.73 
 
 		 477 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  27.98 
 
 		 457 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>