More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2081 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2081  Amidase  100 
 
 		 546 aa  1042    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  50.83 
 
 		 535 aa  385  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  48.38 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  43.28 
 
 		 408 aa  225  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  39.94 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  37.08 
 
 		 400 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  37.71 
 
 		 386 aa  207  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  37.1 
 
 		 378 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  33.97 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  36.73 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  37.77 
 
 		 391 aa  201  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  40.36 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  42.12 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  40.38 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  38.64 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  36.36 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  39.42 
 
 		 396 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  34.05 
 
 		 405 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  40.96 
 
 		 393 aa  188  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  41.27 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  38.11 
 
 		 401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  35.18 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  34.07 
 
 		 398 aa  183  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  37.47 
 
 		 401 aa  183  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  38.95 
 
 		 341 aa  169  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  33.17 
 
 		 576 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  38.67 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  37.34 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  31.51 
 
 		 423 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  30.48 
 
 		 411 aa  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.36 
 
 		 463 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  35.05 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  33.76 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  28.65 
 
 		 388 aa  146  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  34.02 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  41.1 
 
 		 416 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  33.76 
 
 		 447 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  32.3 
 
 		 449 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  29.31 
 
 		 423 aa  140  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  34.96 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  34.31 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  31.75 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  33.75 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  34.09 
 
 		 425 aa  136  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  37.4 
 
 		 435 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  34.96 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  35.35 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  34.94 
 
 		 413 aa  133  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  34.19 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  33.01 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  33.16 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  32.72 
 
 		 440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  33.83 
 
 		 450 aa  128  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  37.28 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  34.5 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  33.51 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  34.46 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  36.24 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  32.99 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  34.31 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  36.47 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  32.92 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  32.22 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2848  Amidase  27.14 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  30.95 
 
 		 597 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  33.6 
 
 		 422 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  28.54 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  34.98 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  34.98 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  34.98 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  31.78 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  34.98 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.94 
 
 		 482 aa  117  6e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  34.89 
 
 		 467 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  34.89 
 
 		 467 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  27.03 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  34.64 
 
 		 467 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  29.23 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  31.33 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  31.93 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1011  indole acetimide hydrolase  32.53 
 
 		 484 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0836853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  35.34 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  32.82 
 
 		 437 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3739  Amidase  29.43 
 
 		 446 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  33.67 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  34.74 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.42 
 
 		 458 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  32.83 
 
 		 441 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  30.49 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  34.46 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  29.48 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  33.59 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  33.24 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  28.9 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  34.55 
 
 		 422 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4592  amidase  34.3 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317108  normal  0.0439274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  34.1 
 
 		 447 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  27.59 
 
 		 398 aa  107  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29 
 
 		 480 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.65 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>