More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1572 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  801    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  43.15 
 
 		 535 aa  264  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  44.65 
 
 		 546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  45.89 
 
 		 579 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  39.08 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  38.98 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  37.91 
 
 		 405 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  39.84 
 
 		 411 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  41.74 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  36.41 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  37.07 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  38.67 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  36.08 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  40.16 
 
 		 393 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  36.32 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  39.78 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  38.03 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  37.83 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  38.03 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  37.83 
 
 		 396 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  34.63 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  35.7 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  36.83 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  33.85 
 
 		 576 aa  176  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  37.8 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  36.81 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  37.16 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  35.25 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  39.89 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  34.03 
 
 		 449 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  29.75 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  30.53 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  35.55 
 
 		 457 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  32.56 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  49.09 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  39.8 
 
 		 416 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  36.55 
 
 		 451 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  32.64 
 
 		 449 aa  136  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  35.41 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.71 
 
 		 464 aa  133  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  33.77 
 
 		 450 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  35.99 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  32.47 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  33.51 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  30.29 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  34.23 
 
 		 379 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  33.87 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  35.17 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  31.79 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  32.56 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  32.65 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  35.71 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  31.51 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.99 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  33.6 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  30.75 
 
 		 449 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  30.08 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  31.68 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  33.52 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  31.19 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  32.49 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  31.28 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  29.87 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  30.17 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  30.75 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  30.05 
 
 		 456 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.17 
 
 		 491 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  47.26 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  34.39 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  36.34 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  33.68 
 
 		 463 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  32.6 
 
 		 467 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  31.72 
 
 		 467 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  31.22 
 
 		 408 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  31.65 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  32.6 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  29.82 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  32.12 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  50.97 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  33.6 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  33.52 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  32.36 
 
 		 467 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  33.68 
 
 		 470 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  32.36 
 
 		 467 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  32.36 
 
 		 467 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  32.36 
 
 		 454 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2012  amidase  32.29 
 
 		 471 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0494879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  28.22 
 
 		 471 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1654  amidase  31.71 
 
 		 458 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838482  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  44.52 
 
 		 459 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  35.41 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  31.17 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  43.79 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  41.63 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1693  amidase  32.37 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.070698 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  30.75 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  33.96 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4441  amidase  36.27 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  30.45 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3235  amidase  32.37 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0114439  normal  0.388231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>