More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  100 
 
 		 535 aa  1032    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  50.66 
 
 		 546 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  47.63 
 
 		 579 aa  306  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  43.22 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  41.89 
 
 		 405 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  42.45 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  44.1 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  41.35 
 
 		 391 aa  226  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  37.28 
 
 		 392 aa  224  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  37.91 
 
 		 405 aa  220  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  38.02 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  40 
 
 		 393 aa  206  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  40.9 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  40.78 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  39.72 
 
 		 389 aa  204  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  36.87 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  37.56 
 
 		 378 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  38.25 
 
 		 395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  37.93 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  38.46 
 
 		 395 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  38.99 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  38.73 
 
 		 401 aa  190  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  37.6 
 
 		 423 aa  189  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  35.77 
 
 		 576 aa  187  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  36.9 
 
 		 399 aa  183  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  38.48 
 
 		 341 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  33.25 
 
 		 411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  33.52 
 
 		 398 aa  173  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  41.6 
 
 		 364 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  31.98 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  34.46 
 
 		 449 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  33.5 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  34.54 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  34.55 
 
 		 449 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  33.77 
 
 		 449 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  34.34 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  33.93 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  33.85 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  32.47 
 
 		 462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  35.36 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.57 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  33.59 
 
 		 449 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  37.56 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  33.96 
 
 		 440 aa  130  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  33.77 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  32.63 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.16 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  35.16 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  38.44 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  32.04 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  31.44 
 
 		 450 aa  124  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  34.78 
 
 		 442 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  32.89 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  33.16 
 
 		 413 aa  123  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  31.07 
 
 		 449 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  35.56 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  31.7 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  33.52 
 
 		 408 aa  120  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  30.41 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  37.57 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.34 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  34.46 
 
 		 435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  30.75 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  35.77 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.26 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.09 
 
 		 463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  32.23 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  32.23 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.85 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1693  amidase  34.58 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.070698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0857  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.88 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  31.07 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1654  amidase  32.9 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3453  amidase  32.37 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  33.77 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  34.58 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1125  amidase  33.33 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0767616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1297  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.08 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3194  amidase  32.37 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3332  amidase  32.37 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2012  amidase  33.16 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0494879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  34.04 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  34.04 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  31.83 
 
 		 468 aa  114  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  31.12 
 
 		 440 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  32.53 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  46.71 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.41 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0721  amidase  31.54 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  33.16 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.32 
 
 		 491 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  32.72 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  32 
 
 		 454 aa  110  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.71 
 
 		 431 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  32.02 
 
 		 470 aa  110  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  24.19 
 
 		 482 aa  109  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  31.69 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  26.15 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  32.03 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0653  amidase  32.44 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>