More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1937 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1937  amidase  100 
 
 		 396 aa  798    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  65.45 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  61.88 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  46.56 
 
 		 395 aa  312  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  47.75 
 
 		 401 aa  311  9e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  47.75 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  44.65 
 
 		 395 aa  295  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  48.87 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  40.26 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  41.07 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  41.44 
 
 		 392 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  45.31 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  39.38 
 
 		 386 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  38.93 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  38.21 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  38.27 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  40.62 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  40.58 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  40.51 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  40.51 
 
 		 399 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  39.68 
 
 		 546 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  35.73 
 
 		 576 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.93 
 
 		 535 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  36.26 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  39.66 
 
 		 579 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  36.64 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  38.54 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  31.19 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  37.2 
 
 		 379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  33.59 
 
 		 456 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  31.51 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  38.03 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  36.05 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  31.35 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  34.3 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.7 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  32.21 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  35.75 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  36.61 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  31.25 
 
 		 449 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  33.41 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  31.51 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  35.85 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  34.34 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  32.83 
 
 		 601 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  31.84 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  32.28 
 
 		 440 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  31.34 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  30.95 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.69 
 
 		 464 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  35.87 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  30.97 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  31.95 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  29.89 
 
 		 511 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  31.89 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4441  amidase  35.41 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5086  amidase  38.29 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752662 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  30.91 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  30.03 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  33.76 
 
 		 576 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  31.09 
 
 		 449 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  33.33 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  29.16 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  32.44 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  31.96 
 
 		 467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  31.95 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  31.96 
 
 		 467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  27.98 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  32.44 
 
 		 467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  31.96 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  31.96 
 
 		 467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  33.85 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  31.63 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.51 
 
 		 481 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  34.22 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  29.47 
 
 		 600 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  29.58 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  34.03 
 
 		 457 aa  126  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  32.73 
 
 		 603 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  31.71 
 
 		 467 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  29.79 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  30.48 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0746  amidase  33.69 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  33.75 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.04 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3908  amidase  35.99 
 
 		 374 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3335  amidase  34.24 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5032  amidase  34.24 
 
 		 446 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  33.67 
 
 		 451 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  32.47 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  30.67 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4961  amidase  34.05 
 
 		 446 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439817  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  44.09 
 
 		 473 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  31.44 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  33.58 
 
 		 611 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.74 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3612  amidase  35.99 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  32.28 
 
 		 600 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.44 
 
 		 479 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  30.53 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>