More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2426 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2426  amidase  100 
 
 		 398 aa  815    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  44.42 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  44.04 
 
 		 405 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  40.16 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  42.67 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  37.79 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  38.7 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  37.23 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  36.87 
 
 		 399 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  38.81 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  41.36 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  39.34 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  38.01 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  36.39 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  37.28 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  36.77 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  39.3 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  34.23 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  36.65 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  36.65 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  35.68 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  33.5 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  34.44 
 
 		 546 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  34.64 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  36.49 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  32.93 
 
 		 341 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.8 
 
 		 535 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  34.44 
 
 		 408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  31.92 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  29.94 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  34.41 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  30.67 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  29.35 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  32.4 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  30.77 
 
 		 443 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  31.95 
 
 		 413 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  31.17 
 
 		 422 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  28.71 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  29.87 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  30.46 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  31.43 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  28.02 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  30.85 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  27.89 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  31.97 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  28.79 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  29.24 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  31.18 
 
 		 448 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  30.51 
 
 		 442 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  28.76 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  30.08 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  31.2 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  39.13 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  29.11 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  29.02 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  29.72 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  28.72 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  28.32 
 
 		 449 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  28.94 
 
 		 456 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  29.52 
 
 		 450 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  29.92 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  31 
 
 		 450 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  27.23 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  30.24 
 
 		 453 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  29.49 
 
 		 449 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  27.75 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  41.67 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  32.09 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  31.35 
 
 		 435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  30.54 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  27.54 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  42.14 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  29.66 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  26.97 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  30.67 
 
 		 457 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0220  amidohydrolase, AtzE family  31.92 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  28.19 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  28.57 
 
 		 600 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  27.43 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  30.61 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  26.4 
 
 		 462 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  29.34 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.9 
 
 		 479 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.53 
 
 		 491 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  28.01 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  27.17 
 
 		 494 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  29.24 
 
 		 601 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  28.17 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  31.17 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  29.66 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  26.23 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  29.84 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  26.84 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4592  amidase  28.49 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317108  normal  0.0439274 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  26.89 
 
 		 447 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0721  amidase  28.39 
 
 		 475 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.56 
 
 		 485 aa  106  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4961  amidase  29.06 
 
 		 446 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439817  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  35.42 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1654  amidase  28.83 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>