More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6652 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  100 
 
 		 378 aa  747    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  81.96 
 
 		 386 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  41.09 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  40.62 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  40.76 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  37.3 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  40.73 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  37.81 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  36.56 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  39.13 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  39.36 
 
 		 411 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  37.1 
 
 		 546 aa  205  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  38.86 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  38.22 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  38.48 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  35.68 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  38.22 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  39.51 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  39.14 
 
 		 579 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  37.4 
 
 		 399 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.31 
 
 		 535 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  34.2 
 
 		 576 aa  180  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  37.67 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  35.9 
 
 		 389 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  37.57 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  36.39 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  37.7 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  36.64 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  34.48 
 
 		 447 aa  146  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  29.97 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  32.41 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  34.67 
 
 		 408 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  31.1 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  32.98 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  30.93 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  31.09 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  36.22 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  32.45 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  30.42 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.54 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  34.58 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  33.65 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  31.95 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  31.21 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  34.44 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  31.41 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  32.56 
 
 		 449 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  32.98 
 
 		 440 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  32.05 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  47.43 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  39.75 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  32.36 
 
 		 457 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  34.22 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  47.1 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  38.12 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  39.59 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  32.39 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  34.27 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  31.62 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  32.39 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  33.14 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.55 
 
 		 464 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  35.83 
 
 		 607 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.42 
 
 		 491 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.89 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  49.31 
 
 		 607 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  42.64 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  34.16 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  31.08 
 
 		 611 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  33.13 
 
 		 469 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  34.12 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  32.07 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  29.29 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  31.62 
 
 		 449 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  31.68 
 
 		 484 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  48.08 
 
 		 437 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  32.59 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.55 
 
 		 475 aa  119  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  29.54 
 
 		 388 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4592  amidase  31.44 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317108  normal  0.0439274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  36.26 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  32.81 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.43 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  36.07 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  33.02 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  36.69 
 
 		 625 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  38.68 
 
 		 484 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  46.39 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0746  amidase  36.71 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  44.85 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  32.78 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  44.71 
 
 		 599 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  30.46 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  48.61 
 
 		 603 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  29.87 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  33.52 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  31.15 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4364  amidase  35.2 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000480403  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  47.95 
 
 		 473 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  43.6 
 
 		 600 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>