More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4057 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4057  amidase  100 
 
 		 393 aa  761    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  52.39 
 
 		 399 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  50 
 
 		 393 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  49.87 
 
 		 394 aa  305  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  47.15 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  44.87 
 
 		 395 aa  285  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  45.73 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  45.27 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  42.66 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  47.46 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  42.16 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  42.36 
 
 		 391 aa  269  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  44.91 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  44.76 
 
 		 411 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  42 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  42 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  44.54 
 
 		 341 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  43.94 
 
 		 389 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  42.01 
 
 		 576 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  40.16 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  39.67 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  42.63 
 
 		 546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  46.99 
 
 		 579 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.55 
 
 		 535 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  41.07 
 
 		 408 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  37.33 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  35.42 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  31.51 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  40.81 
 
 		 364 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.93 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  35.18 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  28.76 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  36.29 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  37.14 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  35.52 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  35.38 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  31.83 
 
 		 454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.15 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  30.71 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  32.69 
 
 		 422 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  35.84 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  34.79 
 
 		 467 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  34.1 
 
 		 442 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.67 
 
 		 485 aa  136  8e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  33.25 
 
 		 449 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  35.77 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  34.77 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  33.07 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  33.25 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  35.47 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  31.95 
 
 		 462 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  36.1 
 
 		 453 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  36.18 
 
 		 457 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  34.18 
 
 		 466 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  33.84 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  37.81 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.15 
 
 		 479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.96 
 
 		 470 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  34.17 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0903  amidase  35.46 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00690645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.53 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  31.95 
 
 		 449 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  34.36 
 
 		 458 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  31.7 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  38.5 
 
 		 569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  35.54 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  38.27 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  32.36 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  35.28 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  33.51 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.43 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3194  amidase  33.92 
 
 		 465 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3453  amidase  33.92 
 
 		 465 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3332  amidase  33.92 
 
 		 465 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0320  pyrazinamidase/nicotinamidase  51.68 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.92 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.65 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5086  amidase  37.43 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  31.38 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  34.86 
 
 		 601 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  34.91 
 
 		 467 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  36.77 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  34.9 
 
 		 454 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  34.9 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  34.9 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  30.82 
 
 		 511 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  34.9 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0208  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.91 
 
 		 453 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.382536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  34.66 
 
 		 467 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  33.01 
 
 		 459 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  32.65 
 
 		 465 aa  122  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.73 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4592  amidase  36.34 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317108  normal  0.0439274 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  30.51 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  32.06 
 
 		 601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  34.62 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  31.74 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  34.66 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.78 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5032  amidase  35.32 
 
 		 446 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>