More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5086 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5086  amidase  100 
 
 
374 aa  725    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.752662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  88.46 
 
 
374 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3612  amidase  87.64 
 
 
374 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3908  amidase  88.46 
 
 
374 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  85.99 
 
 
374 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  86.54 
 
 
374 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  74.45 
 
 
374 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  74.18 
 
 
374 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0320  pyrazinamidase/nicotinamidase  76.24 
 
 
375 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  56.45 
 
 
369 aa  355  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  55.16 
 
 
379 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  50.56 
 
 
408 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  50.4 
 
 
377 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0746  amidase  51.48 
 
 
382 aa  276  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  36.24 
 
 
400 aa  159  7e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  36.88 
 
 
449 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.92 
 
 
475 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  36.36 
 
 
403 aa  158  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  38.13 
 
 
396 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.44 
 
 
431 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  32.55 
 
 
405 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  35.33 
 
 
395 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0857  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.74 
 
 
434 aa  149  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.68 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  35.93 
 
 
447 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  38.37 
 
 
500 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  36.67 
 
 
456 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  33.33 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  32.07 
 
 
401 aa  146  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0772  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.62 
 
 
433 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.630554  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.93 
 
 
485 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  33.58 
 
 
476 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  32.25 
 
 
470 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.09 
 
 
479 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.12 
 
 
486 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  33.6 
 
 
400 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1194  Amidase  38.46 
 
 
393 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0374201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  40.85 
 
 
451 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.05 
 
 
486 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  36.77 
 
 
427 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  35.38 
 
 
401 aa  143  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  34.2 
 
 
452 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  37.9 
 
 
463 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  36.99 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  30.91 
 
 
423 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5981  amidase  36.87 
 
 
468 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0693963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.84 
 
 
463 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.46 
 
 
485 aa  139  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  37.64 
 
 
416 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  33.6 
 
 
447 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.66 
 
 
479 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.36 
 
 
486 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  34.65 
 
 
449 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2843  Amidase  32.35 
 
 
503 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.942957  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  35.39 
 
 
449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  36.86 
 
 
457 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1297  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.99 
 
 
433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.65 
 
 
483 aa  136  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  31.78 
 
 
455 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.15 
 
 
464 aa  136  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0907  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.39 
 
 
452 aa  136  8e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0978  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.83 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  34.46 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  35.19 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  31.96 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2421  amidase  31.64 
 
 
511 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2208  amidase  32.45 
 
 
511 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  36.03 
 
 
457 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.25 
 
 
483 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  35.71 
 
 
457 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0611  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.59 
 
 
453 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000302545  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  35.64 
 
 
449 aa  133  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.49 
 
 
485 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.52 
 
 
475 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  34.92 
 
 
401 aa  132  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3028  amidase  34.24 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  31.46 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  34.86 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  33.93 
 
 
462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  32.07 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1547  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.05 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  34.57 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7392  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.25 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  35.57 
 
 
450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  31.98 
 
 
468 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  32.81 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  30.27 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  30.54 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.37 
 
 
480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.52 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  33.97 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.99 
 
 
479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  35.97 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  32.88 
 
 
465 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  37.09 
 
 
467 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  37.09 
 
 
467 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  32.48 
 
 
467 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1654  amidase  32.74 
 
 
458 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838482  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.51 
 
 
481 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  49.66 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>