More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5348 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5348  amidase  100 
 
 		 374 aa  720    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  97.53 
 
 		 374 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  89.29 
 
 		 374 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3612  amidase  89.29 
 
 		 374 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3908  amidase  89.56 
 
 		 374 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5086  amidase  86.19 
 
 		 374 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  70.88 
 
 		 374 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  70.33 
 
 		 374 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0320  pyrazinamidase/nicotinamidase  76.52 
 
 		 375 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  57.26 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  56.37 
 
 		 379 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  50.42 
 
 		 408 aa  294  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  49.6 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0746  amidase  53.91 
 
 		 382 aa  282  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  37.56 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  35.84 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  36.87 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  35.62 
 
 		 452 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  34.59 
 
 		 405 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  36.55 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.58 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.81 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  32.88 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  34.81 
 
 		 476 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  38.66 
 
 		 463 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  35.28 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  35.71 
 
 		 403 aa  149  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  34.32 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.79 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.14 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  32.3 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  35.71 
 
 		 449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.93 
 
 		 485 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  33.33 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0857  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.99 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  37.9 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  37.3 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  35.31 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.49 
 
 		 486 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  32.41 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.25 
 
 		 479 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  37.16 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  34.29 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  37.76 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.12 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  37.81 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1194  Amidase  38.19 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0374201  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  34.39 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  31.05 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.84 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  30.63 
 
 		 455 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  34.84 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.22 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  36.75 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2843  Amidase  32.61 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.942957  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  35.17 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  34.13 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  35.23 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  34.78 
 
 		 511 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.41 
 
 		 485 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  37.6 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  36.13 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0721  amidase  36.84 
 
 		 475 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  35.58 
 
 		 467 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0772  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.06 
 
 		 433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.630554  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.24 
 
 		 483 aa  136  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  34.56 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  32.53 
 
 		 378 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.68 
 
 		 479 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.09 
 
 		 483 aa  135  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5981  amidase  36.56 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0693963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.7 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  37.33 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1297  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.34 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.58 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.9 
 
 		 479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  34.47 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  35.75 
 
 		 457 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.73 
 
 		 486 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  32.35 
 
 		 391 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1547  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.92 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  34.7 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  32.6 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  34.21 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0485  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.21 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  31.93 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  34.73 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.73 
 
 		 486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.05 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  37.22 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0208  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.32 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.382536  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.65 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  34.38 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0907  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.64 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0835  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.01 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.417948  normal  0.79256 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  52.32 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1499  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.42 
 
 		 472 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000099116  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  50.93 
 
 		 456 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.38 
 
 		 481 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2421  amidase  32.26 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>