More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1592 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1592  amidase  100 
 
 
401 aa  816    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  75 
 
 
401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  75.44 
 
 
400 aa  579  1e-164  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  76.63 
 
 
403 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  40.77 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  41.28 
 
 
463 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  38.08 
 
 
388 aa  218  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  40.63 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  36.36 
 
 
470 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.41 
 
 
475 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  37.19 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.32 
 
 
461 aa  189  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  37.13 
 
 
398 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.3 
 
 
475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0177  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.49 
 
 
471 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.979626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.51 
 
 
464 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.63 
 
 
485 aa  176  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.93 
 
 
486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  35.07 
 
 
467 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  36.65 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  42.51 
 
 
455 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.4 
 
 
480 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.5 
 
 
485 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.02 
 
 
483 aa  169  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2421  amidase  31.89 
 
 
511 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  31.96 
 
 
486 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.71 
 
 
486 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2208  amidase  32.22 
 
 
511 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  34.24 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.22 
 
 
485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.72 
 
 
486 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.16 
 
 
479 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.25 
 
 
485 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  36.48 
 
 
427 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.5 
 
 
486 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.64 
 
 
483 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  32.93 
 
 
465 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2205  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.62 
 
 
499 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.65 
 
 
426 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  34.04 
 
 
395 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.71 
 
 
491 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.09 
 
 
494 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  31.16 
 
 
446 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.87 
 
 
463 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33 
 
 
477 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  35.7 
 
 
452 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  33.42 
 
 
484 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4296  amidase  36.36 
 
 
474 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.581919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  33.65 
 
 
457 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1297  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.91 
 
 
433 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.01 
 
 
479 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  34.04 
 
 
447 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.51 
 
 
458 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.4 
 
 
487 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1580  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.41 
 
 
488 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.1 
 
 
479 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2843  Amidase  30.14 
 
 
503 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.942957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  36.16 
 
 
416 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.06 
 
 
505 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0869  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  30.23 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0362034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  30.4 
 
 
511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5981  amidase  33.89 
 
 
468 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0693963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1989  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.23 
 
 
485 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1955  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.23 
 
 
485 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0835  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.86 
 
 
434 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.417948  normal  0.79256 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  33.57 
 
 
459 aa  153  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1547  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.5 
 
 
472 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460524  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.05 
 
 
485 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0772  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.88 
 
 
433 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.630554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.57 
 
 
489 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  33.77 
 
 
450 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  31.89 
 
 
466 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  32.2 
 
 
484 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  33.94 
 
 
476 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.78 
 
 
484 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.5 
 
 
497 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  32.63 
 
 
457 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.23 
 
 
489 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  30.16 
 
 
457 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.24 
 
 
488 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4038  amidase  28.94 
 
 
504 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144423  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1933  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.93 
 
 
474 aa  150  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.129092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.29 
 
 
491 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.38 
 
 
477 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.83 
 
 
431 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.5 
 
 
484 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  31.98 
 
 
470 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0530  Amidase  34.25 
 
 
491 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1438  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.45 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.41 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  32.35 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  34.45 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.56 
 
 
495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1499  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.74 
 
 
472 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000099116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.12 
 
 
518 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00466527  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  32.44 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  34.14 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  32.88 
 
 
374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.26 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  32.4 
 
 
614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>