More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2215 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  100 
 
 		 379 aa  750    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  59.29 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  56.71 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  56.16 
 
 		 374 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  56.32 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  52.75 
 
 		 374 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3908  amidase  56.44 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  52.75 
 
 		 374 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3612  amidase  55.89 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5086  amidase  55.68 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0746  amidase  54.27 
 
 		 382 aa  312  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  53.17 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0320  pyrazinamidase/nicotinamidase  54.42 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  47.07 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.53 
 
 		 475 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  32.5 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  37.2 
 
 		 396 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.17 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.17 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  35.07 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  39.44 
 
 		 400 aa  163  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  37.33 
 
 		 454 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  36.08 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  34.95 
 
 		 449 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  34.13 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.1 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.95 
 
 		 485 aa  160  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.14 
 
 		 483 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0772  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.84 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.630554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.18 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  33.51 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  37.75 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.99 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  32.33 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  35 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  36.62 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  34.44 
 
 		 378 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.09 
 
 		 485 aa  153  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  33.7 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  35.1 
 
 		 401 aa  152  8e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.23 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  34.03 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.11 
 
 		 479 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0857  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.58 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  38.15 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  32.88 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  32.99 
 
 		 456 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.77 
 
 		 464 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.22 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  36.22 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  36.05 
 
 		 500 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  37.47 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.82 
 
 		 485 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  32.11 
 
 		 463 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.17 
 
 		 426 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  35.71 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  35.71 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  35.71 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  32.54 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  35.71 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0688  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.92 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.98 
 
 		 481 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  35.97 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  32.28 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.43 
 
 		 491 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.83 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.32 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  36.51 
 
 		 461 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.22 
 
 		 461 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  31.47 
 
 		 452 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.18 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1297  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.58 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  32.39 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.12 
 
 		 488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  35.98 
 
 		 546 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.82 
 
 		 479 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  33.15 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.17 
 
 		 486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.24 
 
 		 485 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  34.9 
 
 		 476 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  33.59 
 
 		 459 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  32.99 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  34.65 
 
 		 399 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1547  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.85 
 
 		 472 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1227  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.76 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1499  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.6 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000099116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  38.69 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  33.87 
 
 		 466 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  36.24 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  36.34 
 
 		 458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  36.04 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  34.75 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  32.42 
 
 		 486 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  32.74 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  36.89 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  35.09 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.13 
 
 		 477 aa  136  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.59 
 
 		 487 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  36.49 
 
 		 416 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  31.74 
 
 		 511 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>