More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0099 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0091  amidase  99.5 
 
 		 401 aa  804    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  100 
 
 		 401 aa  808    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  80 
 
 		 395 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  51.77 
 
 		 395 aa  356  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  47.75 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  46.17 
 
 		 393 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  44.11 
 
 		 394 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  45.41 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  39.79 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  42.04 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  42.67 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  40.11 
 
 		 392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  41.77 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  37.88 
 
 		 405 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  38.17 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  36.48 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  38.22 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  36.65 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  35.22 
 
 		 576 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  37.74 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  41.09 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  41.55 
 
 		 579 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  38.06 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  37.47 
 
 		 546 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  40.33 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.2 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  36.52 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  37.23 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  31.11 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  35.14 
 
 		 452 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  31.48 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  32.23 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  34.98 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  34.65 
 
 		 440 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  34.69 
 
 		 408 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  35.56 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.25 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  30.05 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  33.59 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  30.81 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  32.21 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  33.94 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  31.56 
 
 		 457 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  35.86 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  32.74 
 
 		 456 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  31.61 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  33.25 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  34.96 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.01 
 
 		 483 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.92 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  30.83 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  30.83 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  36.14 
 
 		 450 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  30.79 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  34.63 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  34.05 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  37.3 
 
 		 462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  28.83 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  31.21 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  37.59 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  32.6 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  36.13 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  31.07 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  29.06 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  31.45 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  33.02 
 
 		 469 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  32.41 
 
 		 457 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.67 
 
 		 457 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  31.39 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  30.79 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.83 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  32.4 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  30.23 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  34.52 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  35.09 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  32.48 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  31.28 
 
 		 463 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  35.36 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  32.98 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  30.59 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  31.71 
 
 		 458 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  30.29 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  42.13 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  32.65 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0320  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.44 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.37 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  31.4 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.78 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1769  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.85 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  34.28 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  30.98 
 
 		 437 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  41.24 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  33.98 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  33.13 
 
 		 467 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3908  amidase  32.45 
 
 		 374 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  34.3 
 
 		 377 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  33.85 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  30.71 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.03 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  32.9 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>