More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5251 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  100 
 
 		 399 aa  797    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  46.72 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  43.65 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  38.06 
 
 		 405 aa  249  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  39.58 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  41.16 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  39.84 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  38 
 
 		 576 aa  226  6e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  37.76 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  39.64 
 
 		 411 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  37.86 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  38.93 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  40.38 
 
 		 389 aa  215  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  40.51 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  36.77 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  39.66 
 
 		 401 aa  212  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  40.38 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  41.22 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  37.53 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  40.36 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  38.12 
 
 		 546 aa  209  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  40.76 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  35.05 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  37.67 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  41.14 
 
 		 579 aa  186  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.6 
 
 		 535 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  36.81 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  30.15 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  29.72 
 
 		 411 aa  159  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  36.8 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  32.98 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  39.84 
 
 		 364 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  34.03 
 
 		 449 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  35.13 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  37.1 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  32.85 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  34.65 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  32.17 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.75 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  31.82 
 
 		 467 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  45.29 
 
 		 440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  33.16 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4592  amidase  50.96 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317108  normal  0.0439274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  30.4 
 
 		 511 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  44.91 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  35.17 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  50.9 
 
 		 601 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.83 
 
 		 475 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  32.88 
 
 		 607 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  48.19 
 
 		 611 aa  123  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  48.47 
 
 		 603 aa  123  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  31.12 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  46.67 
 
 		 457 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  33.77 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  31.59 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  30.85 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.17 
 
 		 458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  31.01 
 
 		 597 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  42.42 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  49.34 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  47.77 
 
 		 456 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  30.79 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  30.73 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  30.79 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  31.97 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  45.68 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  30.54 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  30.54 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  30.54 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  30.54 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  45.62 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  48.72 
 
 		 611 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.08 
 
 		 475 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  46.15 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  32.67 
 
 		 625 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  46.3 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  46.06 
 
 		 442 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.95 
 
 		 486 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  32.4 
 
 		 449 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  31.57 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  46.01 
 
 		 607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  47.77 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  40.7 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  34.39 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  41.8 
 
 		 440 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  32.05 
 
 		 614 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  41.14 
 
 		 449 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.71 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  32.62 
 
 		 374 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  31.12 
 
 		 465 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  47.83 
 
 		 473 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  41.95 
 
 		 463 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  43.48 
 
 		 459 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  36.04 
 
 		 596 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  38.19 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  33.08 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  47.33 
 
 		 600 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  46.63 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  40.74 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  44.44 
 
 		 448 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>