More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6340 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6340  amidase  100 
 
 		 440 aa  871    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  88.41 
 
 		 440 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  63.72 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  64.72 
 
 		 452 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  65.82 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  63.88 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  51.71 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  56.18 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  52.15 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  51.94 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  50.23 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  56.13 
 
 		 453 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  52.1 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  50.93 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  50.93 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  48.55 
 
 		 447 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  48.88 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  54.73 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  51.4 
 
 		 449 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  53.93 
 
 		 457 aa  362  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  54.04 
 
 		 458 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  54.04 
 
 		 458 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  54.06 
 
 		 476 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  53.62 
 
 		 462 aa  358  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  54.94 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  48.4 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  54.73 
 
 		 458 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  53.58 
 
 		 458 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  53.58 
 
 		 472 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  53.58 
 
 		 458 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  53.58 
 
 		 472 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  53.58 
 
 		 616 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  53.58 
 
 		 616 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  53.58 
 
 		 616 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  50.69 
 
 		 451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  50.57 
 
 		 450 aa  343  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  54.04 
 
 		 458 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  53.81 
 
 		 458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  54.73 
 
 		 459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  49.77 
 
 		 450 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  51.41 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  52.37 
 
 		 448 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  48.28 
 
 		 413 aa  319  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  53.98 
 
 		 481 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  51.87 
 
 		 448 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  50.39 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  47.78 
 
 		 469 aa  302  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  45.67 
 
 		 423 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  41.8 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  41.54 
 
 		 459 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  41.35 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  48.41 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  42.05 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  43.07 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  43.08 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  43.08 
 
 		 446 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  39.4 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  40.16 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  39.48 
 
 		 437 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  39.68 
 
 		 457 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  39.55 
 
 		 442 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  37.23 
 
 		 440 aa  226  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  36.69 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  47.79 
 
 		 435 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  40.84 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  35.73 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  37.76 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  46.56 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  40.72 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  37.64 
 
 		 465 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  41.18 
 
 		 435 aa  206  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.95 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.71 
 
 		 461 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.04 
 
 		 463 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  36.88 
 
 		 407 aa  192  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  35.87 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  37.41 
 
 		 436 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  38.88 
 
 		 473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  37.41 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.26 
 
 		 467 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  33.77 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0989  amidase  35.29 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  36.71 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  34.5 
 
 		 461 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  36.28 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.03 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.17 
 
 		 470 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.59 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.68 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  28.75 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  31.7 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  33.71 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  44.1 
 
 		 508 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  34.19 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  37.04 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  34.68 
 
 		 468 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  43.75 
 
 		 464 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  35.76 
 
 		 463 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  32.97 
 
 		 470 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  33.33 
 
 		 471 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>