More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0172 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2373  amidase  86.46 
 
 		 458 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  100 
 
 		 458 aa  886    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  87.55 
 
 		 458 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  99.79 
 
 		 472 aa  914    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  86.24 
 
 		 458 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  100 
 
 		 458 aa  886    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  86.24 
 
 		 458 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  95.31 
 
 		 476 aa  770    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  99.51 
 
 		 616 aa  1186    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  86.24 
 
 		 458 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  87.77 
 
 		 458 aa  698    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  81.24 
 
 		 462 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  86.24 
 
 		 458 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  100 
 
 		 616 aa  1196    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  100 
 
 		 616 aa  1196    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  99.79 
 
 		 472 aa  914    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  81.18 
 
 		 459 aa  624  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  80.69 
 
 		 481 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  57.87 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  52.68 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  53.17 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  54.12 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  53.42 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  54.13 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  53.44 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  53.67 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  56.07 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  55.48 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  54.71 
 
 		 453 aa  392  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  53.72 
 
 		 440 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  50.78 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  56.49 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  54.04 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  50.22 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  51.83 
 
 		 449 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  53.25 
 
 		 457 aa  362  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  56.11 
 
 		 457 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  53.52 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  50.11 
 
 		 451 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  49.09 
 
 		 457 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  47.29 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  47.67 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  52.27 
 
 		 453 aa  312  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  47.46 
 
 		 448 aa  303  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  47.46 
 
 		 448 aa  302  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  47.43 
 
 		 413 aa  299  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  50.25 
 
 		 441 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  42.98 
 
 		 456 aa  283  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  43.14 
 
 		 457 aa  281  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  42.39 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  41.04 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  42.63 
 
 		 452 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  41.78 
 
 		 456 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  46.82 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  42.33 
 
 		 453 aa  243  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  48.86 
 
 		 435 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  42.56 
 
 		 446 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  42.05 
 
 		 437 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  42.56 
 
 		 446 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  40 
 
 		 443 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  47.85 
 
 		 427 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  37.53 
 
 		 440 aa  211  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  35.65 
 
 		 447 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  39.7 
 
 		 407 aa  209  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  39.75 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  40.91 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  40.13 
 
 		 443 aa  203  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.33 
 
 		 464 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  39.69 
 
 		 442 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  40.36 
 
 		 435 aa  197  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  40.51 
 
 		 460 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  37.96 
 
 		 432 aa  194  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.39 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  34.12 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.99 
 
 		 470 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  37.03 
 
 		 468 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.68 
 
 		 461 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  35.79 
 
 		 473 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  35.93 
 
 		 454 aa  174  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.99 
 
 		 463 aa  173  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  32.9 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.05 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  36.78 
 
 		 465 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.45 
 
 		 467 aa  171  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.64 
 
 		 485 aa  171  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.34 
 
 		 486 aa  170  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  33.19 
 
 		 549 aa  170  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.61 
 
 		 486 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.84 
 
 		 508 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  34.27 
 
 		 471 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.81 
 
 		 486 aa  167  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  34.48 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  34.48 
 
 		 471 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  38.7 
 
 		 441 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0989  amidase  32.27 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.86 
 
 		 512 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  34.9 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  34.63 
 
 		 458 aa  165  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  38.77 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  31.67 
 
 		 462 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>