More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4084 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4084  amidase  100 
 
 
460 aa  896    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  77.37 
 
 
446 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  77.14 
 
 
446 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  48.71 
 
 
443 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  41.01 
 
 
450 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  44.85 
 
 
447 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  41.8 
 
 
449 aa  249  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  38.07 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  39.01 
 
 
449 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  41.01 
 
 
449 aa  243  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  40 
 
 
456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  39.18 
 
 
449 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  40.97 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  40 
 
 
449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  44.47 
 
 
451 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  41.88 
 
 
440 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  41.21 
 
 
457 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  39.59 
 
 
449 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  41.71 
 
 
453 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  41.58 
 
 
450 aa  226  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  37.56 
 
 
459 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  41.82 
 
 
447 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  40.67 
 
 
450 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  38.42 
 
 
456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  39.27 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  39.95 
 
 
413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  40.7 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  43.85 
 
 
457 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  40.68 
 
 
448 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  36.67 
 
 
423 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  40.68 
 
 
452 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  40.94 
 
 
453 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  42.49 
 
 
458 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  37.78 
 
 
456 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  42.86 
 
 
458 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  37.92 
 
 
469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  39.2 
 
 
441 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  42.78 
 
 
476 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  41.84 
 
 
458 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  41.84 
 
 
458 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  36.87 
 
 
453 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  42.28 
 
 
458 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  42.28 
 
 
616 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  42.28 
 
 
458 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  42.28 
 
 
616 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  42.28 
 
 
616 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  42.28 
 
 
472 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  42.28 
 
 
472 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  40.41 
 
 
448 aa  186  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  42.86 
 
 
458 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  40.15 
 
 
448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  37.98 
 
 
441 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  42.35 
 
 
458 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  40.88 
 
 
462 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  41.22 
 
 
458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  39.74 
 
 
453 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  37.43 
 
 
427 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  38.24 
 
 
451 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  38.38 
 
 
459 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  36.93 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  38.13 
 
 
481 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  31.79 
 
 
447 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  34 
 
 
442 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  34.17 
 
 
457 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  34.38 
 
 
437 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.16 
 
 
464 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  32.29 
 
 
432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  34.47 
 
 
440 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  41.51 
 
 
427 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  36.14 
 
 
477 aa  153  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  38.71 
 
 
475 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  35.94 
 
 
465 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  31.16 
 
 
388 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  36.99 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  36.96 
 
 
441 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  40.05 
 
 
435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  33.42 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  32.29 
 
 
447 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  31.48 
 
 
398 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  31.25 
 
 
407 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  34.81 
 
 
467 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  32.04 
 
 
395 aa  138  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  29.95 
 
 
457 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  33.42 
 
 
400 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  29.58 
 
 
446 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  33.5 
 
 
461 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  31.39 
 
 
601 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  31.79 
 
 
599 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  36.71 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4364  amidase  32.25 
 
 
471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000480403  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8287  indole acetimide hydrolase  29.4 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  36.86 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.71 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  33.16 
 
 
443 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.43 
 
 
486 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  34.96 
 
 
435 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  34.44 
 
 
454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  32.54 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  31.03 
 
 
599 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  32.07 
 
 
596 aa  127  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>