More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4452 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  100 
 
 		 446 aa  872    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  96.86 
 
 		 446 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  75.29 
 
 		 460 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  49.54 
 
 		 443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  41.69 
 
 		 456 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  40.84 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  39.35 
 
 		 463 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  42.65 
 
 		 440 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  39.77 
 
 		 449 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  41.41 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  39.81 
 
 		 449 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  43.34 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  39.11 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  42.11 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  43.16 
 
 		 453 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  40.42 
 
 		 449 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  40.58 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  41.83 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  42.86 
 
 		 457 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  42.89 
 
 		 452 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  43.08 
 
 		 451 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  38.94 
 
 		 459 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  42.19 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  43.29 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  40.62 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  41.49 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  38.67 
 
 		 456 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  45.01 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  38.61 
 
 		 456 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  43.73 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  36.88 
 
 		 423 aa  210  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  37.72 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  39.69 
 
 		 413 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  43.19 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  39.12 
 
 		 453 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  42.16 
 
 		 458 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  42.16 
 
 		 458 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  43.62 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  40.32 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  42.56 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  42.56 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  42.56 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  42.56 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  37.47 
 
 		 469 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  42.56 
 
 		 616 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  42.56 
 
 		 616 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  42.56 
 
 		 616 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  43.19 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  39.43 
 
 		 441 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  38.89 
 
 		 427 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  40.46 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  40.75 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  42.71 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  42.64 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  39.95 
 
 		 448 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  42.03 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  42.78 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  38.99 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  38.73 
 
 		 441 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  38.22 
 
 		 451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  34.85 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  35.06 
 
 		 457 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  39.9 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  35.64 
 
 		 437 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  35.32 
 
 		 432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  34.89 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  36.36 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  37.63 
 
 		 465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.41 
 
 		 464 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  38.46 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  36.05 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  36.05 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.77 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  41.51 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  30.41 
 
 		 447 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  32.37 
 
 		 388 aa  146  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  40.42 
 
 		 435 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  31.37 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.65 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  31.88 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  32.96 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  35.95 
 
 		 578 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  34.64 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  35.95 
 
 		 578 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  35.95 
 
 		 578 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  32.85 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  35.41 
 
 		 458 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  31.07 
 
 		 462 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  34.32 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7392  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.63 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  33.68 
 
 		 443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.45 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  32.4 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.31 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  32.85 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.54 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.49 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.48 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  30.97 
 
 		 601 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  33.93 
 
 		 408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>