More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1841 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  100 
 
 
578 aa  1125    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  100 
 
 
578 aa  1125    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  100 
 
 
578 aa  1125    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  57.62 
 
 
553 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  54.61 
 
 
627 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  55.38 
 
 
540 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  57.29 
 
 
595 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  57.66 
 
 
554 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  53.31 
 
 
603 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  52.36 
 
 
565 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  53.2 
 
 
572 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  43.37 
 
 
601 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  42.54 
 
 
597 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  42.28 
 
 
599 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  43.19 
 
 
599 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  43.59 
 
 
633 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  43.41 
 
 
618 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  44.48 
 
 
597 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  46.22 
 
 
623 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  43.05 
 
 
596 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  44.01 
 
 
607 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  43.36 
 
 
631 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  44.06 
 
 
606 aa  363  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  43.17 
 
 
614 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  46.06 
 
 
600 aa  362  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  43.28 
 
 
600 aa  362  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  45.42 
 
 
603 aa  360  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  39.59 
 
 
607 aa  359  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  45.26 
 
 
611 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  45.34 
 
 
611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  47.07 
 
 
623 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  42.73 
 
 
598 aa  354  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  45.32 
 
 
601 aa  355  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  44.78 
 
 
589 aa  354  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  44.19 
 
 
596 aa  354  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  42.11 
 
 
590 aa  349  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  44.48 
 
 
601 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  46.75 
 
 
599 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  44.57 
 
 
609 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  42.96 
 
 
601 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  43.65 
 
 
601 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  44.4 
 
 
596 aa  343  7e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  42.73 
 
 
601 aa  343  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  44.72 
 
 
621 aa  343  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  42.16 
 
 
616 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  43.55 
 
 
604 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  42.17 
 
 
624 aa  341  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  43.59 
 
 
604 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  42.16 
 
 
609 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  40.98 
 
 
625 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  37.89 
 
 
600 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  39.21 
 
 
598 aa  335  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  40.95 
 
 
1822 aa  332  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  41.74 
 
 
604 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  43.55 
 
 
609 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  41.84 
 
 
628 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  41.9 
 
 
600 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  41.92 
 
 
576 aa  327  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  41.74 
 
 
600 aa  323  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  40.89 
 
 
601 aa  323  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  46.34 
 
 
588 aa  323  6e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  44.7 
 
 
621 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  43.78 
 
 
569 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  40.66 
 
 
569 aa  310  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  51.4 
 
 
484 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  49.75 
 
 
502 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  39.53 
 
 
620 aa  280  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  44.71 
 
 
523 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  39.67 
 
 
460 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  40.15 
 
 
471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  42.38 
 
 
456 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  39.76 
 
 
467 aa  224  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  41.52 
 
 
467 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  41.52 
 
 
467 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  34.03 
 
 
437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  35.25 
 
 
463 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  38.16 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  35.43 
 
 
446 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  35.84 
 
 
446 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  34.03 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  34.2 
 
 
450 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  33.67 
 
 
449 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  32.72 
 
 
456 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  35.01 
 
 
443 aa  144  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  41.41 
 
 
248 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  41.41 
 
 
248 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.5 
 
 
485 aa  141  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.77 
 
 
458 aa  141  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  34.81 
 
 
449 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  38.8 
 
 
491 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  34.95 
 
 
457 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.66 
 
 
480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.38 
 
 
464 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  34.03 
 
 
454 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  32.98 
 
 
440 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  44.07 
 
 
455 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  37.11 
 
 
427 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  31.23 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  34.2 
 
 
449 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.42 
 
 
485 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>