More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2686 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2686  amidase  100 
 
 
437 aa  871    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  76.04 
 
 
407 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  62.91 
 
 
435 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  54.76 
 
 
427 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  56.34 
 
 
435 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  52.22 
 
 
427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  42.35 
 
 
456 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  39.63 
 
 
452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  44.36 
 
 
457 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  41.09 
 
 
456 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  42.82 
 
 
413 aa  275  9e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  39 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  42.97 
 
 
450 aa  270  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  40.09 
 
 
456 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  41.79 
 
 
449 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  40.9 
 
 
440 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  40.14 
 
 
449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  43.08 
 
 
451 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  40.87 
 
 
449 aa  259  9e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  39.72 
 
 
457 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  40.2 
 
 
449 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  39.66 
 
 
447 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  45.13 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  39.81 
 
 
469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  40.81 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  43.15 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  40.46 
 
 
450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  38.3 
 
 
463 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  40.36 
 
 
449 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  40.18 
 
 
448 aa  249  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  40.9 
 
 
448 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  40.18 
 
 
448 aa  246  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  39.85 
 
 
453 aa  245  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  39.08 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  39.64 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  38.85 
 
 
442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  40.16 
 
 
449 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  38.85 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  37.01 
 
 
423 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  44.36 
 
 
462 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  37.73 
 
 
457 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  40.94 
 
 
452 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  38.79 
 
 
453 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  40.15 
 
 
457 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  41.62 
 
 
453 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  42.36 
 
 
458 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  41.16 
 
 
458 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  42.49 
 
 
616 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  42.49 
 
 
616 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  42.49 
 
 
616 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  42.49 
 
 
458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  42.49 
 
 
458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  42.49 
 
 
472 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  42.49 
 
 
472 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  35.14 
 
 
447 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  41.41 
 
 
458 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  41.41 
 
 
458 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  41.73 
 
 
476 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  41.6 
 
 
458 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  41.16 
 
 
458 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  40.72 
 
 
458 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  40.5 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  37.99 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  34.72 
 
 
440 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  34.81 
 
 
443 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  39.7 
 
 
481 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  37.9 
 
 
477 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  35.38 
 
 
446 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  35.57 
 
 
473 aa  186  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  39.09 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  35.64 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.76 
 
 
463 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  37.01 
 
 
458 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  35.12 
 
 
454 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.47 
 
 
470 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.9 
 
 
461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  31.46 
 
 
466 aa  173  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  38.18 
 
 
491 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  37.05 
 
 
436 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  34.67 
 
 
463 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  33.18 
 
 
471 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.79 
 
 
470 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  36.79 
 
 
441 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  37.72 
 
 
416 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  33.04 
 
 
471 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.6 
 
 
470 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  31.61 
 
 
466 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.29 
 
 
457 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  36.36 
 
 
443 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  36.75 
 
 
441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  32.71 
 
 
473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5308  amidase  32.35 
 
 
466 aa  166  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3243  amidase  32.88 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  35.75 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  33.41 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  35.75 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  35.2 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  34.63 
 
 
422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  32.25 
 
 
468 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  34.58 
 
 
475 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>