More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0782 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  100 
 
 
465 aa  941    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  100 
 
 
465 aa  941    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  57.08 
 
 
464 aa  508  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  54.75 
 
 
462 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  59.69 
 
 
482 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  54.65 
 
 
457 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  60.05 
 
 
467 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0721  amidase  61.24 
 
 
475 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0653  amidase  58.78 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1654  amidase  63.83 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2012  amidase  59.28 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0494879  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2141  amidase  60.4 
 
 
461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408812  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3028  amidase  56.54 
 
 
467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1693  amidase  58.84 
 
 
471 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.070698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0772  amidase  57.4 
 
 
472 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0317505  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1125  amidase  59.51 
 
 
471 aa  435  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0767616  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  51.56 
 
 
465 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  51.12 
 
 
468 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0846  amidohydrolase, AtzE family  51.64 
 
 
464 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  50.22 
 
 
466 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  52.03 
 
 
470 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3713  amidase  55.68 
 
 
469 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0903  amidase  49.66 
 
 
469 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00690645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3194  amidase  48.91 
 
 
465 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3332  amidase  48.91 
 
 
465 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3453  amidase  48.91 
 
 
465 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0220  amidohydrolase, AtzE family  48.97 
 
 
454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  38.75 
 
 
470 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  38.53 
 
 
470 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  42.53 
 
 
463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4441  amidase  44.07 
 
 
446 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4961  amidase  43.85 
 
 
446 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439817  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5252  amidase  43.4 
 
 
446 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5032  amidase  43.4 
 
 
446 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3335  amidase  43.4 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18597  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  40.22 
 
 
449 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  39.91 
 
 
463 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.41 
 
 
480 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  38.51 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.54 
 
 
475 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  38.9 
 
 
473 aa  239  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  38.05 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.68 
 
 
485 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  37.55 
 
 
471 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.68 
 
 
461 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  37.11 
 
 
461 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.79 
 
 
485 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.93 
 
 
489 aa  227  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  35.81 
 
 
447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0518  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.89 
 
 
483 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1650  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.89 
 
 
483 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.85 
 
 
475 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  36.68 
 
 
454 aa  226  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.76 
 
 
491 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.33 
 
 
485 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.05 
 
 
491 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.87 
 
 
486 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.36 
 
 
497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.53 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.26 
 
 
484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1438  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.51 
 
 
485 aa  219  7e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.92 
 
 
485 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  36.65 
 
 
487 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.14 
 
 
483 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.56 
 
 
483 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.83 
 
 
485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0373  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.92 
 
 
487 aa  217  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2730  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.68 
 
 
485 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0351101  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.21 
 
 
484 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2489  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.79 
 
 
490 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.111465  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  33.19 
 
 
549 aa  216  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.83 
 
 
491 aa  216  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0068  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.38 
 
 
474 aa  216  9e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049622 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.69 
 
 
486 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12630  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.36 
 
 
483 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5097  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.67 
 
 
484 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.48 
 
 
494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.59 
 
 
486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0638  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.54 
 
 
494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58180  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.61 
 
 
484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  34.52 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.19 
 
 
470 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.79 
 
 
479 aa  213  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.97 
 
 
486 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1989  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.74 
 
 
485 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.83 
 
 
485 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1955  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.74 
 
 
485 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2827  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  38.25 
 
 
499 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.68 
 
 
479 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.13 
 
 
481 aa  210  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.52 
 
 
463 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.99 
 
 
499 aa  209  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.85 
 
 
483 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6767  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  39.57 
 
 
501 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.05 
 
 
486 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.61 
 
 
486 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0170  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.47 
 
 
486 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132896  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3194  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.11 
 
 
484 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000437561  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.77 
 
 
486 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.41 
 
 
483 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>